崇明西红花根际土壤和球茎微生物多样性分析

发布时间：2021-08-24 00:43

　　为研究崇明西红花栽培地根际土壤和球茎中微生物多样性,采用Illumina MiSeq高通量测序技术对其微生物群落组成进行了比对分析。结果表明,西红花根际土壤和球茎中细菌和真菌在门类水平上菌群类别差异不显著,但在丰富度和多样性方面根际土壤明显高于球茎;在属和种水平上差异显著;在种水平上,根际土壤或球茎均有各自特有的细菌或真菌,且具有较高的相对丰度。西红花致病真菌瓶霉（Phialophora）和背芽突霉（Cadophora）在崇明西红花球茎大量存在。因此,推测西红花病害发生,除与土壤菌群相关外,与其内生细菌和真菌也紧密相关。本研究结果初步分析了崇明栽培地西红花根际土壤和球茎中微生物多样性及群落结构组成,为进一步筛选合适的崇明西红花栽培地土壤和种球杀菌剂提供了理论依据。 

【文章来源】：核农学报. 2020,34(11)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

西红花根际土壤和球茎中细菌

通过Ⅰ-Sanger 生信云平台分析根际土壤和球茎中细菌和真菌在种水平上的差异表达。由图3可知,西红花根际土壤中细菌相对丰度显著高于球茎,在球茎中相对丰度极低,甚至未检出;而蓝细菌(Cyanobacteria)、链霉菌(Streptomyces)、芽孢杆菌(Bacillus)和糖多孢菌(Saccharopolyspora)在球茎中的相对丰度显著高于根际土壤,其中球茎和根际土壤的Cyanobacteria相对丰度分别为13.74%和0.16%,Streptomyces分别为8.26%和0.06%;球茎中芽孢杆菌、糖多孢菌的相对丰度分别是根标土壤的11.73和291.91倍。由图4可知,根际土壤和球茎中真菌在种水平上的差异表达与细菌规律相似,除了未分类的真菌,根际土壤中相对丰度较高的真菌在球茎中相对丰度基本低于0.001%,而球茎中相对丰度较高的真菌在根际土壤中的相对丰度基本低于0.013%。在球茎中大量检测到Penicillium、Penicillium_roseopurpureum、Penicillium_steckii、Exobasidium_sp和Cadophora,相对丰度分别为7.86%、7.07%、6.64%和6.20%和5.65%,而根际土壤中基本均为0.01%左右。此外,Cadophora仅在西红花球茎中检出。图3 西红花根际土壤和球茎中细菌群落在种水平上的组成差异

西红花根际土壤和球茎中细菌群落在种水平上的组成差异

【参考文献】：
期刊论文
[1]“标准+种植”双平台共造崇明西红花生态圈[J]. 孙华,俞灵琦.  华东科技. 2018(08)
[2]马铃薯间作栽培对土壤微生物群落结构与功能的影响[J]. 刘亚军,马琨,李越,杜春凤,李倩,李贺,马玲,汪春明.  核农学报. 2018(06)
[3]应用IlluminaMiSeq高通量测序技术分析河西走廊地区盐碱土壤微生物多样性[J]. 牛世全,龙洋,李海云,达文燕,胡山,李渭娟,朱学泰,孔维宝.  微生物学通报. 2017(09)
[4]影响西红花产量和品质的诸因素研究进展[J]. 姚冲,刘兵兵,周桂芬,蒋凤琴,余静芬,冷华南,顾志康.  中药材. 2017(03)
[5]HPLC法测定浙江慈溪水稻田栽培的西红花中西红花苷Ⅰ、Ⅱ含量的研究[J]. 戴智慧,黄士文,倪穗,胡伟.  中国野生植物资源. 2016(02)
[6]不同轮作制下长期施肥旱地土壤微生物多样性特征[J]. 蔡艳,郝明德,臧逸飞,何晓雁,张丽琼.  核农学报. 2015(02)
[7]浙江省西红花“二段法”优质高产栽培技术研究[J]. 饶君凤,王根法,吕伟德.  安徽农业科学. 2012(09)
[8]药用西红花特征特性及其栽培技术[J]. 徐伟.  浙江中西医结合杂志. 2011(12)

硕士论文
[1]Cd和Pb对崇明东滩湿地土壤中细菌、真菌和放线菌的Hormesis效应研究[D]. 黄斌.南京林业大学 2017
[2]西红花生物学特性、离体快繁及质量评价研究[D]. 彭海君.浙江农林大学 2014
[3]西红花致病菌的分离鉴定及其防治药物的筛选[D]. 赵丽娟.上海师范大学 2014
[4]长三角地区土壤不同发育阶段微生物群落结构的变化[D]. 孟晗.复旦大学 2011



本文编号：3358927