多粘类芽孢杆菌LRS-1对辣椒疫霉病害根际土壤细菌多样性的影响

发布时间：2025-04-27 00:27

　　 【目的】研究多粘类芽孢杆菌LRS-1生防菌对患疫霉病的辣椒根际土壤细菌多样性的影响。【方法】通过对无病阴性对照(CK)、辣椒疫霉菌阳性处理(PC)和生防菌+辣椒疫霉菌处理(LRS1) 3个处理的盆栽根际土壤样品16S r RNA基因的V3-V4区进行高通量测序,并对下机数据予以相关生物信息学分析,获得了不同处理根际土壤细菌的OTU丰度、Alpha多样性、OTUs分布、群落组成差异以及PCA聚类分析等数据结果。【结果】各处理间的根际土壤细菌群落变化明显,疫霉菌处理明显降低了根际土壤细菌群落的丰富度和多样性,而接种多粘类芽孢杆菌LRS-1则可明显改善根际土壤细菌群落丰富度与多样性;接种LRS-1明显提高了辣椒根际土壤细菌种类组成的相似性,并改善疫霉菌胁迫下的细菌种类组成;各处理的优势物种类群均分布于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria),但疫霉胁迫条件下Sphingomonadaceae、Clostridiales物种丰度显著降低,而Burkholderiales、Micrococcales等物种丰度显著增加,接...

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【部分图文】：

图1 根际土壤细菌OTUs丰度稀释曲线

用Alpha多样性分析反映样本中细菌群落的丰富度与多样性，其中Ace指数和Chao指数描述细菌群落丰富度，shannon指数描述细菌群落多样性。Alpha多样性分析结果显示（表1），无论Ace指数、Chao指数或Shanno指数，各处理的数值结果均表现为CK>LRS1>PC，说明....

图2 根际细菌OTUs分布韦恩图

如图2所示，各根际土壤样本共获得1069个细菌OTUs，其3者共有OTUs数量为664，占OTUs总数的62.11%，说明疫霉菌的胁迫或生防菌LRS1的修复对辣椒根际土壤细菌OUT丰度具有明显影响。CK处理的根际土壤样本与PC处理的根际土壤样本共有715个细菌OTUs,CK处理的....

图3 门水平上的根际细菌相对丰度柱状图

根据各处理根际土壤样本OTU中代表序列的物种注释结果，选取在细菌门和属分类水平上丰度最大的前10名物种生成物种相对丰度柱状图（图3和图4）。从图3可以看出，就门分类水平而言，根际土壤细菌排名前10的物种为：变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）....

图4 属水平上的根际细菌群落饼图

在属分类水平上平均丰度大于1%的根际土壤细菌物种主要有Massilia、Microvirga、Bacillus、Tepidisphaeraceae、Chitinophagaceae、Flavisolibacter、Sphingomonadaceae、Sporolactobacil....

本文编号：4041596