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2018年北京市学校呼吸道人腺病毒感染疫情病原学鉴定及中国不同患者人腺病毒检出率Meta分析

发布时间:2024-05-08 01:28
  2018年5~9月,北京市西城区五所学校先后共报告了 5起呼吸道感染集中发热疫情。为了解报告的5起疫情的流行病学和病原学特征,开展了现场调查,采集病例咽拭子标本,使用荧光定量PCR检测17种常见呼吸道病毒进行病原学筛查,对鉴定为人腺病毒(Human adenovirus,HAdV)阳性的标本进行病毒分离,并分别扩增六邻体蛋白基因Loop2区域、三个衣壳蛋白(五邻体基座蛋白、六邻体蛋白和纤维蛋白)基因以及全基因组序列全长,进行HAdV型别的初筛和确认,同时与Genbank数据库中国内外人腺病毒3型(Human adenovirus type 3,HAdV-3)流行株序列进行比对分析。结果显示,5起集中发热疫情的致病原均为HAdV-3。进一步研究发现,2004年至今我国流行的HAdV-3病毒株均属于Clade2进化分支,也是近年全球优势流行株。两个进化分支HAdV-3病毒株在基因序列水平上均高度保守。本研究为我国呼吸道HAdV防控,以及HAdV-3型疫苗研发提供了基础科学数据。人腺病毒可以引起多种疾病,并不时引发呼吸道疾病的暴发流行,为了了解人腺病毒在不同疾病病原谱中的检出情况,本研究对符...

【文章页数】:78 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图1基于Hexon基因Lo〇P2区对2018年北京市西城区呼吸道感染疫情标本进行初步型别鉴定??注:▲?HAdV-A-G中各代表型别的原型株序列??Figurel?

图1基于Hexon基因Lo〇P2区对2018年北京市西城区呼吸道感染疫情标本进行初步型别鉴定??注:▲?HAdV-A-G中各代表型别的原型株序列??Figurel?

)。结果显示,23?份??标本获得阳性扩增产物(表6),扩增成功率为92%?(23/25),经序列测定和分析显示,??所有标本在Loop2区域的序列高度一致(100%)。进一步BLAST序列分析显示,所有序??列与GenBank数据库中的HAdV-3株高度同源(100%)。??每....


图2基于Penton?base?(a)、Hexon?(b)、Fiber基因(c)和全基因组(d)构建人腺病毒3型???

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图3文献筛选流程图??Figure3?Flow?chart?of?literature?screening??

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中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所?硕士学位论文??三结果??3.1文献检索结果??中英文检索共检索到797篇中国HAdV检出率相关文献,其中中文493??篇,英文304篇。根据制定的纳入和排除标准,对检索到的所有文献进行文献??去重、初筛和复筛,最终纳入文献274篇(284个....


图4漏斗图??Figure4?The?Hinnel?plot??

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重要结??构基因。Penton?base蛋白HVL2区含有典型的Arg-Gly-Asp?(RGD)基序,能与??宿主细胞整合素相互作用,介导病毒的内吞%?Hexon基因的L〇〇pl(HVRl?6)??和Loop2(HVR7)具有型特异性结构域,测定任一区域都可对HAdV进行初步的....



本文编号:3967287

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