稻瘟病抗性位点Pik-InDel分子标记开发及其在育种上的应用

发布时间:2024-05-25 13:42
  水稻Pik位点含有至少6个抗病基因,它们都包含在该位点功能区域中。因此,有效区分出功能区域是鉴定该基因座功能基因的首要条件。本研究通过对水稻抗稻瘟病Pik基因座上已克隆的功能基因,包括Pik、Pi-kp、Pi-kh、Pi-1、Pi-km和Pi-ks及非功能基因序列的相互对比,鉴定到Pik基因座特异的核苷酸差异,开发了基于PCR技术的Pik基因座的插入/缺失(insert-deletion, InDel)标记,能有效地将Pik上功能基因与其它非功能基因的基因座区分开。利用Pik基因座的分离群体进行标记选择与接种鉴定,结果表明Pik-InDel标记能精确的选择出Pik功能基因座。用Pik-InDel标记对20份重要水稻不育系进行分子检测,该标记能准确地将抗性基因座与其它非抗病基因座区分开来,这为筛选水稻稻瘟病抗性种质资源,以及抗性标记辅助抗病育种提供了便利。

【文章页数】:4 页

【部分图文】:

图1日本晴与部分同源功能基因在差异位点的序列比对

图1日本晴与部分同源功能基因在差异位点的序列比对

为确定Pik-InDel标记对Pik位点功能基因选择效果,本研究构建了IRBL1-CL(Pi1)与LTH的F2代分离群体,并利用Pi1基因非亲和菌株CHL346接种鉴定。鉴定结果表明,在200株分离群体中,有141株表现抗病,59株表现感病,符合3∶1的分离比。经Pik-InDe....


图2Pik-InDel在Pik基因簇区域不同稻瘟病抗性基因及日本晴,LTH的验证

图2Pik-InDel在Pik基因簇区域不同稻瘟病抗性基因及日本晴,LTH的验证

图1日本晴与部分同源功能基因在差异位点的序列比对1.3Pik-InDel在20个品种中的筛选应用


图3Pik-InDel应用于20个水稻品种的筛选

图3Pik-InDel应用于20个水稻品种的筛选

针对上述情况,本研究开发出的分子标记,能将Pik位点上的不同功能性等位基因区与非功能基因区分出来,并使用该标记鉴定了20份水稻不育系品种,PCR结果表明这些水稻不育系品种都不含有该位点的功能基因。因此,下一步可以利用Pik位点的功能基因,结合Pik-InDel标记对它们进行改良。....



本文编号:3982183

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