沟眶象和臭椿沟眶象适应性进化的分子基础
发布时间:2022-01-26 21:26
沟眶象 Eucryptorrhynchus scrobiculatus Motschulsky 和臭椿沟眶象Eucryptorrhynchus brandti(Harold)属于鞘翅目 Coleoptera,象甲科 Curculionidae,隐喙象亚科Cryptorhynchinae,沟眶象属Eucryptorrhynchu。沟眶象和臭椿沟眶象是中国臭椿Ailanthus altissima的主要钻蛀性害虫。以幼虫为主要的危害阶段,沟眶象成虫将卵产在土壤表层,幼虫在土壤内活动取食寄主根系;臭椿沟眶象成虫将卵产在树干表层,幼虫在寄主树干韧皮部和形成层活动取食,两者常混合发生,进一步加剧了对寄主臭椿的危害。沟眶象和臭椿沟眶象在形态,行为及生态方面的相似性和差异性,为我们研究具相似性生态位的同域物种进化过程提供了很好的材料,而物种进化的研究也早已进入到分子水平。本文对沟眶象和臭椿沟眶象的线粒体基因组和沟眶象转录组进行测定和分析,为进一步研究沟眶象和臭椿沟眶象的适应性进化提供前期基础。主要结果如下:1.沟眶象和臭椿沟眶象线粒体基因组序列的测定和注释沟眶象和臭椿沟眶象线粒体全基因组全长分别为1...
【文章来源】:北京林业大学北京市211工程院校教育部直属院校
【文章页数】:120 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
7种鞘翅目昆虫‘oxl基因序列碱基替换散点图
4.2.3分化时间估算??沟眶象和臭椿沟眶象之间的遗传距离为0.173,节肢动物线粒体基因“标准”的??碱基替换速率约为?2.3x10-8?替换/位点?年(Brower,1994;?Papadopouloue/o/.,2010)。??基于固定进化速率的物种分化时间估算:T=d/2r?。其中T为分化时间,i?为分子的分??化/进化速率,d为遗传距离。沟眶象和臭椿沟眶象的分化时间可追溯至大约3.76百??万年(Million?annum,?Ma)以前。??4.?3结论与讨论??本研宄共选取58个物种,除沟眶象和臭椿沟眶象外,在剩余的56个物种中,52??53??
值<le-10,序列相似度>80%),分析在沟眶象转录组中外源基因的分布情况。比对??结果表明大约有111914个reads?(8.8%)与2294物种得到最优匹配。其中超过50%??的reads匹配到13个物种,且鞘翅目昆虫占到了大多数(图5-3)。匹配reads最高的三??个物种分别为山松大小蠹£^?办〇〇/〇?1^?pojwifemsfle?(26283;?23.5%),赤拟谷盗??7h.6o//ww?msto?eww(5014;?4.5%)和松褐天牛?(3,706:?3.3%)。??可以认为在沟眶象RNA提取及测序的过程中并没有受到外缘基因的污染,真实地反??映了沟眶象的转录组数据。但由于沟眶象RNA的提取来自于昆虫样本整体,虽然在??提取前对样本进行清洗,但由于肠道等部位的存在,不可避免会有外源基因的存在,??尤其是与沟眶象共生的内生菌的存在。其中,广泛存在节肢动物体内的昆虫内共生菌??Wolbachia在沟眶象的转录组数据中也获得较高的比例,在获得四配的111914个reads??中共有2089条reads匹配到Wolbachia
【参考文献】:
期刊论文
[1]沟眶象体内感染的Wolbachia的wsp基因克隆与序列分析[J]. 高朋,刘振凯,温俊宝. 环境昆虫学报. 2015(04)
[2]宁夏地区沟眶象、臭椿沟眶象生物学特性初步研究[J]. 吴韶寰,王建国,郎杏茹,孙普,邢丽荣,何泽玉. 现代园艺. 2012(24)
[3]臭椿沟眶象和沟眶象的为害及防治对策[J]. 白瑞霞. 河北农业科学. 2012(01)
[4]臭椿沟眶象生物学特性与综合防控技术研究[J]. 孙占林,冯怡. 宁夏农林科技. 2011(07)
[5]臭椿沟眶象发生规律及综合防治技术研究[J]. 李正荣,黎学仁,梁建宁. 宁夏农林科技. 2010(04)
[6]氯胺膦防治沟眶象、臭椿沟眶象效果初探[J]. 安旭,王素琴,郑丽芳. 河北林业. 2010(01)
[7]四纹豆象不同地理种群的遗传分化[J]. 顾杰,毛雅琴,王莉萍,许佳君,张愚,杜予州. 昆虫学报. 2009(12)
[8]臭椿研究综述[J]. 申洁梅,刘占朝,张万钦,范增伟,刘国顺. 河南林业科技. 2008(04)
[9]沟眶象的生物学特性及行为观察[J]. 杨贵军,雍惠莉,王新谱. 昆虫知识. 2008(01)
[10]检疫性枝干害虫臭椿沟眶象[J]. 张秀玲,马桂花,王浩德. 植物检疫. 2007(03)
硕士论文
[1]沟眶象关键基础生物学特性研究[D]. 张艳.北京林业大学 2015
[2]沟眶象生物学特性及人工饲养初探[D]. 于倩倩.北京林业大学 2013
[3]北美外来入侵植物臭椿的重要天敌臭椿沟眶象研究[D]. 张刘伟.扬州大学 2007
本文编号:3611193
【文章来源】:北京林业大学北京市211工程院校教育部直属院校
【文章页数】:120 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
7种鞘翅目昆虫‘oxl基因序列碱基替换散点图
4.2.3分化时间估算??沟眶象和臭椿沟眶象之间的遗传距离为0.173,节肢动物线粒体基因“标准”的??碱基替换速率约为?2.3x10-8?替换/位点?年(Brower,1994;?Papadopouloue/o/.,2010)。??基于固定进化速率的物种分化时间估算:T=d/2r?。其中T为分化时间,i?为分子的分??化/进化速率,d为遗传距离。沟眶象和臭椿沟眶象的分化时间可追溯至大约3.76百??万年(Million?annum,?Ma)以前。??4.?3结论与讨论??本研宄共选取58个物种,除沟眶象和臭椿沟眶象外,在剩余的56个物种中,52??53??
值<le-10,序列相似度>80%),分析在沟眶象转录组中外源基因的分布情况。比对??结果表明大约有111914个reads?(8.8%)与2294物种得到最优匹配。其中超过50%??的reads匹配到13个物种,且鞘翅目昆虫占到了大多数(图5-3)。匹配reads最高的三??个物种分别为山松大小蠹£^?办〇〇/〇?1^?pojwifemsfle?(26283;?23.5%),赤拟谷盗??7h.6o//ww?msto?eww(5014;?4.5%)和松褐天牛?(3,706:?3.3%)。??可以认为在沟眶象RNA提取及测序的过程中并没有受到外缘基因的污染,真实地反??映了沟眶象的转录组数据。但由于沟眶象RNA的提取来自于昆虫样本整体,虽然在??提取前对样本进行清洗,但由于肠道等部位的存在,不可避免会有外源基因的存在,??尤其是与沟眶象共生的内生菌的存在。其中,广泛存在节肢动物体内的昆虫内共生菌??Wolbachia在沟眶象的转录组数据中也获得较高的比例,在获得四配的111914个reads??中共有2089条reads匹配到Wolbachia
【参考文献】:
期刊论文
[1]沟眶象体内感染的Wolbachia的wsp基因克隆与序列分析[J]. 高朋,刘振凯,温俊宝. 环境昆虫学报. 2015(04)
[2]宁夏地区沟眶象、臭椿沟眶象生物学特性初步研究[J]. 吴韶寰,王建国,郎杏茹,孙普,邢丽荣,何泽玉. 现代园艺. 2012(24)
[3]臭椿沟眶象和沟眶象的为害及防治对策[J]. 白瑞霞. 河北农业科学. 2012(01)
[4]臭椿沟眶象生物学特性与综合防控技术研究[J]. 孙占林,冯怡. 宁夏农林科技. 2011(07)
[5]臭椿沟眶象发生规律及综合防治技术研究[J]. 李正荣,黎学仁,梁建宁. 宁夏农林科技. 2010(04)
[6]氯胺膦防治沟眶象、臭椿沟眶象效果初探[J]. 安旭,王素琴,郑丽芳. 河北林业. 2010(01)
[7]四纹豆象不同地理种群的遗传分化[J]. 顾杰,毛雅琴,王莉萍,许佳君,张愚,杜予州. 昆虫学报. 2009(12)
[8]臭椿研究综述[J]. 申洁梅,刘占朝,张万钦,范增伟,刘国顺. 河南林业科技. 2008(04)
[9]沟眶象的生物学特性及行为观察[J]. 杨贵军,雍惠莉,王新谱. 昆虫知识. 2008(01)
[10]检疫性枝干害虫臭椿沟眶象[J]. 张秀玲,马桂花,王浩德. 植物检疫. 2007(03)
硕士论文
[1]沟眶象关键基础生物学特性研究[D]. 张艳.北京林业大学 2015
[2]沟眶象生物学特性及人工饲养初探[D]. 于倩倩.北京林业大学 2013
[3]北美外来入侵植物臭椿的重要天敌臭椿沟眶象研究[D]. 张刘伟.扬州大学 2007
本文编号:3611193
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