烟草烟碱含量的全基因组关联分析及其候选基因预测

发布时间：2025-07-02 00:59

　　烟碱是烟草重要的品质性状,明确烟碱含量的调控机制,筛选特异烟碱含量的烟草品种,对提高烟叶品质具有重要的指导意义。然而,直接鉴定烟草种质资源的烟碱含量周期很长、效率偏低、消耗大量人力物力,影响了种质资源的发掘利用。而利用分子标记开展特异烟碱种质的筛选,则能够有效缩短鉴定周期,节约成本,极大提高工作效率。近年来,虽有一些烟碱相关分子标记挖掘工作得以开展,但限于分子标记密度不高、准确度不够等问题,烟碱相关分子标记很少被应用到种质资源的筛选上。而随着二代高通量测序技术的快速发展,RAD测序技术因其所具有的基因组覆盖均匀、成本低、周期短等特点,得到了广泛的应用。同时,得益于高通量测序技术的发展,依赖于SNP标记的全基因组关联分析方法迅速发展为植物复杂数量遗传性状研究的有效手段。本研究对219份烤烟品种开展了RAD重测序,对29份烤烟品种开展全基因组重测序,结合全基因组关联分析的方法,发掘与烟碱含量变异、烟碱合成关键基因表达量显著关联的SNP位点;同时针对关联位点进行相应候选基因的预测,功能标记开发等工作,对烟草烟碱相关分子标记挖掘,高烟碱品种选育等工作具有重要的指导意义。具体研究结果如下:1.对2...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2.3.1供试材料各年点烟碱含量表型变异分析图

图2.3.1供试材料各年点烟碱含量表型变异分析图Fig.2.3.1Variationanalysisofnicotinecontentfromthetestedmaterialsindifferentyear/s2.3.2供试群体简化基因组重测序通....

图2.3.224条染色体的SNP密度分布热图

图2.3.1供试材料各年点烟碱含量表型变异分析图Fig.2.3.1Variationanalysisofnicotinecontentfromthetestedmaterialsindifferentyear/site2.3.2供试群体简化基因组重....

图2.3.3供试群体的N-J聚类树

国农业科学院硕士学位论文第二章烤烟烟碱含量的全基因组关联3.3供试群体遗传多样性分析通过计算供试群体的核苷酸多态性（NucleotidePolymorphism）可知，总群体的π值04051，π(JC)值为：0.04051；国内育成品种的π值为：0.05868，π(JC)....

图2.3.4烟碱含量全基因组关联分析

国农业科学院硕士学位论文第二章烤烟烟碱含量的全基因组关联分2.3.4供试群体SNP变异位点与烟碱含量的全基因组关联分析在依据材料与方法2.2.4的标准进行了数据处理后，将供试群体的烟碱含量表型数据与S据进行关联分析。实际进入关联分析运算的SNP位点共274,....

本文编号：4054971