钱塘江三角鲂线粒体基因组测序及其结构特征分析

发布时间：2021-04-21 13:50

　　为了研究钱塘江流域三角鲂（Megalobrama terminalis Richardson）线粒体基因组结构特征及鲌亚科鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增、测序、软件拼接获得了钱塘江三角鲂线粒体基因组全序列,GenBank登录号为MN725725。结果表明,钱塘江三角鲂线粒体基因组序列全长为16 621 bp,碱基组成分别为A（31.23%）、G（16.17%）、C（27.87%）和T（24.73%）;共有13个蛋白编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因,NAD6、tRNA-Gln、tRNA-Ala、tRNA-Asn、tRNA-Cys、tRNA-Tyr、tRNA-Ser^（UCN）、tRNA-Glu和tRNA-Pro等基因编码在L链上,其余基因均在H链上编码。钱塘江三角鲂线粒体基因组全序列与蛋白编码基因的A+T含量分别为55.97%和55.86%,具有明显的AT偏好性。线粒体基因中存在2个散在重复序列,分别位于线粒体控制区中终止结合序列区的前端和控制区3′的末端。在22个tRNA基因中,除了tRNA-Ser^（AGY）外,均具有典型的三... 

【文章来源】：浙江农业学报. 2020,32(09)北大核心CSCD

【文章页数】：18 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料及DNA提取
    1.2 基因测序
    1.3 序列拼接与分析
    1.4 系统进化树构建
2 结果与分析
    2.1 线粒体基因组结构与组成
    2.2 rRNA与tRNA编码基因结构特征
    2.3 非编码区
    2.4 蛋白编码基因
    2.5 不同流域三角鲂线粒体基因组比较
    2.6 线粒体基因组系统进化分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]黄条鰤线粒体全基因组测序及结构特征分析[J]. 史宝,柳学周,刘永山,张言祥,高全义,徐永江,王滨,姜燕,宋雪松.  中国水产科学. 2019(03)
[2]鱼类线粒体基因组研究进展[J]. 周传江,马爱喆,汪曦,杨长幸,李筝,张常青,朱国超,顾钱洪.  河南师范大学学报(自然科学版). 2019(02)
[3]太平洋鳕线粒体全基因组测序及结构特征分析[J]. 毛明光,顾杰,刘瑞婷,陈雨,吴玲梅,姜志强,蒋洁兰.  水生生物学报. 2019(01)
[4]基于第二代测序技术兰州鲇线粒体基因组全序列测定与分析[J]. 连总强,滚双宝,李力,张锋,肖伟,吴旭东.  水生生物学报. 2017(02)
[5]黄鲫线粒体DNA控制区结构及长度多态性分析[J]. 蔡珊珊,徐胜勇,宋娜,高天翔,张朝晖.  水生生物学报. 2014(05)
[6]不同鳊鲂属鱼类群体的形态差异分析[J]. 陈杰,李福贵,黄创新,蒋霞云,邹曙明.  上海海洋大学学报. 2014(03)
[7]不同鳊鲂鱼类群体微卫星DNA指纹图谱的构建和遗传结构分析[J]. 张倩倩,陈杰,蒋霞云,邹曙明.  水产学报. 2014(01)
[8]鲂属鱼类线粒体基因组的比较及其系统发育分析[J]. 赖瑞芳,张秀杰,李艳和,吴俊颉,杨东辉,王卫民.  水产学报. 2014(01)
[9]RNA二级结构预测及其在分子分类研究中的应用[J]. 杨泽民,谢数涛,章群,张俊彬.  安徽农业科学. 2012(07)
[10]鲂属鱼类细胞色素b片段序列分析[J]. 谢楠,刘新轶,冯晓宇,郭水荣.  现代农业科技. 2012(01)



本文编号：3151874