陆地棉体细胞胚胎发生过程中miRNAs及其靶标的鉴定和GhmiR157a/GhSPL10功能分析
发布时间：2021-12-22 07:39
体细胞胚胎发生体系是研究已分化组织和器官脱分化和再分化的良好模型,也是植物转基因技术的重要依托,对于其机制的研究具有重要的理论和应用价值。micro RNAs（mi RNAs）是一类长度通常为19-25个核苷酸（nt）的内源非编码RNA,在植物的生长发育,激素信号转导,逆境胁迫响应等方面起着重要的作用。然而棉花中关于mi RNAs的研究较少;本研究基于实验室前期筛选的一个高效体细胞胚胎发生的材料YZ1,利用小RNA测序结合降解组测序,鉴定棉花体细胞胚胎发生过程中的小RNA及其靶标基因,研究他们在体细胞胚胎发生过程中的动态调控,综合阐述小RNA及其靶标基因在棉花体细胞胚胎发生中的调控作用;并进一步探讨棉花中Ghmi R157a及其靶标Gh SPL10在棉花脱分化过程中的生物学功能。主要研究结果如下:1、棉花体细胞胚胎发生相关mi RNAs及其靶标基因的挖掘与鉴定本研究构建了YZ1胚性愈伤（EC）和下胚轴（CK,对照）的小RNA测序文库。发现36个家族的保守mi RNAs在两个样品间差异表达,发现属于19个家族的29条保守mi RNAs的前体,同时发现了25个新的mi RNAs及其前体。这...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：142 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
棉花体细胞胚胎发生过程(Yangetal2012)Figure1.1SEprocesseincotton(Yangetal2012)
华中农业大学 2017 届博士研究生学位论文10图1.2 miRNAs生物合成的动态过程(Achkar et al 2016)Figure1.2 Cotranscriptional Assembly of the miRNA Processing Complex (Achkar et al 2016)
iRNAs 及其靶标的鉴定和 GhmiR157a/GhSPL10 功能分析15图1.3 miRNAs介导的基因沉默(Rogers and Chen 2013)Figure 1.3 Overview of miRNA-Mediated Gene Silencing (Rogers and Chen 2013)1.2.3 MIR 基因的进化关于 MIR 基因在进化上是如何产生的？目前主要有两种假说：第一种假说认为MIR 基因是由靶标基因的反向复制演化而来(Allen et al 2004)，即始祖基因经过反向复制，导致完整或部分基因序列形成头对头，或者尾对尾的排列，并且在复制过程中有可能形成新的启动子，转录之后形成折叠结构作为 DCL 的底物产生 siRNA 从而对始祖基因或其成员造成基因沉默。该假说的主要依据是在拟南芥中发现一些MIR基因在miRNA/miRNA*区域外的侧翼序列与其靶标的基因序列存在一定程度的相似性(Allen et al 2004)。这种假说已被实验所证实，比如：ath-miR822、ath-miR839和 ath-miR869 的前体即是被 DCL4 作用形成了 siRNAs (Ben Amor et al 2009;Rajagopalan et al 2006b)。随着进化的过程不断进行，在 DCL1 识别区域以外逐渐产
【参考文献】：
期刊论文
[1]Molecular characterization and expression analysis of Triticum aestivum squamosa-promoter binding protein-box genes involved in ear development[J]. Bin Zhang,Xia Liu,Guangyao Zhao,Xinguo Mao,Ang Li,Ruilian Jing. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(06)
[2]两种常用激素组合下棉花体细胞胚胎发生过程的组织学观察[J]. 朱华国,张献龙,金双侠,刘冠泽. 棉花学报. 2012(02)
[3]一种适合于cDNA文库构建的高质量棉花RNA的简单抽提法（英文）[J]. 朱龙付,涂礼莉,曾范昌,刘迪秋,张献龙. 作物学报. 2005(12)
[4]棉花体细胞胚胎发生和植株再生的影响因素[J]. 迟吉娜,李喜焕,王省芬,张桂寅,马峙英. 棉花学报. 2004(01)
[5]不同激素诱导陆地棉体细胞胚胎发生的效应[J]. 张献龙,王武,刘金兰,孙济中. 华中农业大学学报. 1991(03)
[6]不同基因型棉花下胚轴离体培养胚状体发生的研究[J]. 董合忠. 莱阳农学院学报. 1991(02)
博士论文
[1]海岛棉microRNA及其靶标的鉴定和功能分析[D]. 刘念.华中农业大学 2016
本文编号：3546019
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：142 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
棉花体细胞胚胎发生过程(Yangetal2012)Figure1.1SEprocesseincotton(Yangetal2012)
华中农业大学 2017 届博士研究生学位论文10图1.2 miRNAs生物合成的动态过程(Achkar et al 2016)Figure1.2 Cotranscriptional Assembly of the miRNA Processing Complex (Achkar et al 2016)
iRNAs 及其靶标的鉴定和 GhmiR157a/GhSPL10 功能分析15图1.3 miRNAs介导的基因沉默(Rogers and Chen 2013)Figure 1.3 Overview of miRNA-Mediated Gene Silencing (Rogers and Chen 2013)1.2.3 MIR 基因的进化关于 MIR 基因在进化上是如何产生的？目前主要有两种假说：第一种假说认为MIR 基因是由靶标基因的反向复制演化而来(Allen et al 2004)，即始祖基因经过反向复制，导致完整或部分基因序列形成头对头，或者尾对尾的排列，并且在复制过程中有可能形成新的启动子，转录之后形成折叠结构作为 DCL 的底物产生 siRNA 从而对始祖基因或其成员造成基因沉默。该假说的主要依据是在拟南芥中发现一些MIR基因在miRNA/miRNA*区域外的侧翼序列与其靶标的基因序列存在一定程度的相似性(Allen et al 2004)。这种假说已被实验所证实，比如：ath-miR822、ath-miR839和 ath-miR869 的前体即是被 DCL4 作用形成了 siRNAs (Ben Amor et al 2009;Rajagopalan et al 2006b)。随着进化的过程不断进行，在 DCL1 识别区域以外逐渐产
【参考文献】：
期刊论文
[1]Molecular characterization and expression analysis of Triticum aestivum squamosa-promoter binding protein-box genes involved in ear development[J]. Bin Zhang,Xia Liu,Guangyao Zhao,Xinguo Mao,Ang Li,Ruilian Jing. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(06)
[2]两种常用激素组合下棉花体细胞胚胎发生过程的组织学观察[J]. 朱华国,张献龙,金双侠,刘冠泽. 棉花学报. 2012(02)
[3]一种适合于cDNA文库构建的高质量棉花RNA的简单抽提法（英文）[J]. 朱龙付,涂礼莉,曾范昌,刘迪秋,张献龙. 作物学报. 2005(12)
[4]棉花体细胞胚胎发生和植株再生的影响因素[J]. 迟吉娜,李喜焕,王省芬,张桂寅,马峙英. 棉花学报. 2004(01)
[5]不同激素诱导陆地棉体细胞胚胎发生的效应[J]. 张献龙,王武,刘金兰,孙济中. 华中农业大学学报. 1991(03)
[6]不同基因型棉花下胚轴离体培养胚状体发生的研究[J]. 董合忠. 莱阳农学院学报. 1991(02)
博士论文
[1]海岛棉microRNA及其靶标的鉴定和功能分析[D]. 刘念.华中农业大学 2016
本文编号：3546019
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/nykjbs/3546019.html
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