基于转录组探究PacC介导的苹果黑腐皮壳菌致病机制

发布时间：2025-07-02 00:51

　　 由苹果黑腐皮壳菌（Valsa mali）引起的苹果树（Malus pumila）腐烂病严重制约中国苹果产业的发展,全面解析黑腐皮壳菌的致病分子机制为该病害的有效防控提供重要理论依据。pH响应转录因子PacC在苹果黑腐皮壳菌侵染致病过程中起重要作用。为了揭示其转录调控机制,利用RNA-seq技术对苹果黑腐皮壳菌野生型菌株03-8和PacC基因敲除突变体ΔVmPacC在苹果枝条上的基因表达谱进行分析。结果显示苹果黑腐皮壳菌在前期侵染和后期侵染过程中分别有238和449个差异表达基因（differentially expressed genes, DEGs）。GO富集分析表明,DEGs主要参与碳水化合物代谢、氧化还原、跨膜运输、多糖代谢生物过程。KEGG富集分析表明,DEGs集中在淀粉和蔗糖代谢、氰基氨基酸代谢、戊糖和葡萄糖醛酸转换通路途径,这些途径上的差异基因多与植物细胞壁多糖（plant cell wall polysaccharide, PCWP）降解有关。将与PCWP降解相关基因的氨基酸序列提交到病原寄主互作（Pathogen Host Interactions, PHI）数据库比对...

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【部分图文】：

图3 差异表达基因韦恩图

对PacC和WT转录组比较筛选出的DEGs进行KEGG通路分析，PacC-H和WT-H比较筛选出的DEGs被富集到42条通路途径中，其中戊糖和葡萄糖醛酸转换(mgr00040,9个)富集最显著，其次是淀粉和蔗糖代谢(mgr00500,10个)、氰基氨基酸代谢(mgr00460....

图4 差异表达基因的GO功能富集分析

PCWP降解酶作为病原菌降解植物细胞壁的重要武器，在真菌致病过程中发挥重要作用。数据显示，在PacC-H和WT-H比较筛选出的DEGs中，有14个DEGs参与戊糖和葡萄糖醛酸转换、氰基氨基酸代谢、淀粉和蔗糖代谢过程，这14个DEGs中有13个与PCWP降解相关，其中8个DEGs上....

图2 差异表达基因火山图

图3差异表达基因韦恩图2.5致病相关基因的鉴定

图1 样品的采集示意图

KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGe-nomes)(http://www.genome.jp/kegg/)是系统分析基因功能、基因组信息数据库(Kanehisaetal.,2008)，通过KEGG富集分析来确定DEGs参与的最主要生....

本文编号：4054962