云南普洱蝙蝠病毒组学及其新病原的发现与研究

发布时间：2023-03-26 17:12

　　背景与目的:病毒是自然界最丰富的物种之一,很多病毒严重威胁人类健康。近年来,新发突发病毒性传染病多次发生,鉴于其高度的不可预测性、突发性、病死率高的特点,极易引起社会群体性恐慌。基于第二代高通量测序的病毒宏基因组学技术直接对环境中所有的病毒核酸序列进行检测,为调查已知和未知病毒提供了高效工具,成为发现新病毒的有效手段。蝙蝠分布范围广泛,是许多病毒的自然宿主,能携带包括多种人兽共患病毒在内的170多种病毒。蝙蝠可以通过中间宿主动物、气溶胶或抓咬伤等方式将病毒传播给人类。我国云南省西南边境与东南亚国家接壤,战略意义突出,是多种病毒性疾病的疫源地,研究发现该地区蝙蝠携带有多种人兽共患病毒。本研究旨在调查云南普洱地区蝙蝠携带病毒的多样性并发现新病毒,对防止野生动物源性病毒,特别是蝙蝠源性病毒传播给人类提供指导意义。方法:在不影响蝙蝠种群延续的情况下,本研究于2016年7⁹月在云南普洱各地随机收集84份外表健康的蝙蝠样品,通过PCR方法鉴定蝙蝠品种。利用本实验室建立好的高通量测序样品前处理方法对蝙蝠组织样品处理并进行Hiseq高通量测序;利用生物信息分析平台对测序后的大量数...

【文章页数】：74 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
引言
第一部分 蝙蝠病毒宏基因组学研究
    材料与方法
        1 主要仪器和试剂
        2 生物信息软件
        3 蝙蝠样品采集
        4 蝙蝠种类鉴定及解剖
        5 高通量测序前组织样品处理
        6 IlluminaHiseq测序
        7 测序后生物信息分析
    结果
        1 蝙蝠种类鉴定结果
        2 测序样品质量鉴定结果
        3 病毒宏基因组分析结果
    讨论
第二部分 蝙蝠新病毒的鉴定
    材料与方法
        1 实验仪器、主要试剂和耗材
        2 样品、细胞系和实验动物
        3 生物信息软件
        4 特异性引物设计
        5 病毒核酸提取
        6 病毒RNA反转录
        7 病毒流行病学筛查
        8 病毒基因组扩增
        9 制备DNA分子单克隆
        10 实时荧光定量PCR
        11 DPRV致病性实验
        12 构建病毒进化树
        13 非同义突变替换率/同义突变替换率(dN/dS)比率分析
    结果
        1 新型汉坦病毒DodeHV
        2 新型弹状病毒DPRV
    讨论
研究结论
参考文献
综述
    综述参考文献
伦理证明
攻读学位期间的研究成果
致谢



本文编号：3771362