基因组选择中一步法的应用评价

发布时间：2017-11-10 22:33

  本文关键词：基因组选择中一步法的应用评价

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【摘要】：基因组选择能够通过覆盖全基因组的高密度SNP标记追溯到所有影响目标性状的基因或QTL,从而实现对畜禽个体育种值的准确预测。因此,基因组选择方法具有估计育种值的准确性高等优势,同时可通过早期基因型测定实现早期评估和早期选种,进而缩短世代间隔。实施基因组选择技术需要对个体进行基因型分型,然而对一些经济价值较小的物种(猪或家禽)而言,在实际育种中进行全部个体基因分型是不现实的,而一步法允许部分个体进行基因分型即可实施基因组选择,有效的克服这些物种施基因组选择的一些问题。本研究通一步法在黄羽肉鸡群体中的验证,以及基于猪实际性状遗传结构全基因组数据表型缺失时和表型已知时模拟验证,并且探讨一步法在猪实际育种过程中候选群个体测定基因型比例大小、测定基因型个体的选择。通过对育种值估计的准确性、无偏性及选择反应等结果分析,主要得出以下结论:1本研究中基于R语言开发基因组选择一步法计算评估软件。经过测试,程序稳定可靠,亲缘关系矩阵构建灵活可变,可用于畜禽基因组选择遗传评定计算软件的选择;2一步法在真实数据验证表明:在采食类、生长类和胴体类三类性状中一步法准确性与无偏性优于传统BLUP、GBLUP方法。三大类性状提高幅度依次为:生长类性状5.4%~13.9%、胴体类性状3%~10.1%、采食类性状0.2%~10.7%;3一步法在模拟数据验证表明:无论是验证群在表型缺失时或表型已知时,一步法的准确性优于传统BLUP和GBLUP方法(分别提高~25%、~4%)。一步法在低遗传力性状或验证群表型缺失情况下的运用时,获得更明显的遗传进展;4猪育种过程实施基因组选择一步法模拟研究表明:候选群体基于父母亲平均育种值挑选基因分型个体,基因分型约40%时、既可获得潜在的最大遗传进展。随着参考群不断扩大,每世代遗传评估准确性不断提高,获得更多的遗传进展。
【学位授予单位】：华南农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S813

【参考文献】

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1 张哲;张勤;丁向东;;畜禽基因组选择研究进展[J];科学通报;2011年26期

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本文编号：1168671