基于环状RNA差异性表达探索退行性主动脉瓣疾病的发病机制

发布时间：2023-05-31 19:27

　　[目的]利用高通量测序技术鉴定退行性变主动脉瓣中差异性表达的circRNA,分析circRNA在退行性主动脉瓣瓣膜病发生发展过程可能的分子机制。[方法]获取主动脉瓣置换手术或心脏移植手术患者主动脉瓣组织,留取部分确定病理分型,其余部分液氮冻存以备提取组织RNA。应用高通量测序技术,分别检测正常主动脉瓣组织(正常组)、纤维钙化主动脉瓣组织(纤维钙化组)和粘液样变主动脉瓣组织(粘液样变组)的circRNA表达谱。分析正常组与纤维钙化组、正常组与粘液样变组组间circRNA表达量变化,并对差异性表达的circRNA进行功能富集分析和通路富集分析。此外,应用miRanda软件预测circRNA可能结合的miRNA,通过Targetscan数据库预测miRNA相互作用的mRNA,探索差异表达circRNA可能的作用机制。[结果]病理结果提示,Illumina Hiseq 2500二代测序平台测序样本共15例主动脉瓣,其中正常组6刺、纤维钙化组5例和粘液样变组4例。与正常组相比,纤维钙化组中发现243个差异性表达的circRNA。其中196个表达上调(80.7%),47个表达下调(19.3%)。差...

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