服务于临床基因检测报告的精准医学知识库与应用技术研究

发布时间：2025-06-06 03:36

　　罕见病发病率低,但患者基数大且难以诊疗,严重危害患者身体健康的同时对患者家庭和社会造成严重的经济负担。随着第二代测序技术的成熟,基因检测技术已广泛应用于罕见遗传病的检测。然而传统的临床基因检测报告流程存在着局限性,一方面遗传疾病学知识来源分散,无法快速准确的获取遗传疾病学知识;一方面现阶段测序数据存储方式无法实现大规模患者数量下跨患者变异信息的高效检索、筛选和统计利用;另一方面罕见遗传病难以诊断,缺乏候选疾病推荐服务以辅助遗传病诊断决策;另外工作流程还缺乏系统的信息化管理。这些不足严重影响着传统临床基因检测报告的性能,使其已不能满足现阶段的临床需求。因此亟待针对其中关键问题开展针对性应用研究,并建立服务于临床的基因检测报告系统来辅助临床基因检测报告工作。本论文的具体研究工作包括:(1)服务于临床基因检测报告的精准医学知识库构建。以权威遗传病变异数据解读指南为基础,结合临床基因检测报告实践需求,对常用的12种遗传疾病学数据库进行整合收录,在将原始数据进行标准化和结构化存储的基础上,根据多种临床场景的需求设计15张数据库表间关系和使用规则,并利用原始知识生成遗传疾病学知识网络,构建了精准医学...

【文章页数】：86 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１．１传统测序方式和ＮＧＳ测序方式发现致病基因数量统计??１．１．３传统临床基因检测报告流程??临床医师通过分析患者ＮＧＳ测序的大量基因变异数据，并结合权威遗传疾??

保持了高准确性的前提下能大幅度降低测序??的成本和测序时长（由几年缩短为一周），特别是全外显子组测序（ｗｈｏｌｅ－ｅｘｏｍｅ??ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ，?ＷＥＳ）和目标区域测序技术，可仅仅对约２２０００个外显子或针对特??定临床表型相关的数百基因进行测序［１４］，已经广泛用于临床新....

图１．２传统临床基因检测报告流程??

浙江大学硕士学位论文?＾??１１?＇?■??＇￣￣￣．■一—１??这库??ＺＺＬ??宦网检索??ｖ雜??获取?＿患者表型１０?????篆酿史??图１．２传统临床基因检测报告流程??然而，传统的临床基因检测报告流程在实践过程中存在一些问题，严重影响??了临床基因检测报告工作的效率和....

图２．１精准医学知识库数据表设计图??２．３数据库构建结果??精准医学知识库整合了临床基因检测报告流程中常用的罕见遗传病疾病知??识库、表型知识库、基因和突变知识库、参考文献数据库等多类遺传疾病学知识??

ｎ?ｄｂｓｎｐ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｄｂｖａｒ??ｊ?Ｉ?Ｂ因本体?１?Ｉ?ｄｂｓｎｐ突変?Ｉ?ｄｂｖａｒ突变?：??ｇｅｎｅ?ｎｃｂｉ??Ｌ－一???ｉ?￣｜人类参考基因?：??ｅｎｓｅｍｂｌ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｃｉｉｎｖａｒ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｈｇｍｄ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ....

图２．２ＨＰＯ（ＣＨＰＯ）本体层次结构（鼻窦炎部分）??本文共整合与遗传疾病相关的标准表型共５７３６条，通过公式（２．１）计算任??意表型节点之间的最短距离构建标准表型相似性网络，并通过多维标度分析??

浙江大学硕士学位论文?服务于临床基因检测报告的精准医学知识库构建??“慢性鼻窦炎”节点到“鼻窦炎”节点之间最短距离为】，“急性鼻窦炎”节点??到“鼻窦炎”节点最短距离也为１，则节点“慢性鼻窦炎”和“急性鼻窦炎”之??间的距离为２。ｄｗａｘ表示在整合的ＨＰＯ标准表型数据库中任意表型....

本文编号：4049728