当前位置:主页 > 科技论文 > AI论文 >

生物信息学若干问题研究报告

发布时间:2016-05-31 20:06

  本文关键词:计算智能若干方法的应用研究,由笔耕文化传播整理发布。


《吉林大学》 2012年

生物信息学若干问题研究报告

张书欣  

【摘要】:“生物信息学”是一门崭新的交叉学科,它覆盖了生物学、数学、物理学、化学和计算机科学等众多学科,,目前对它的研究引起了广泛的重视,同时也取得了许多的研究成果。生物信息学主要的研究手段和工具是计算机技术,并同时采用了统计学、数学方面的模型,用来解决生物科学中的某些问题。生物信息学的发展不仅依赖于这些学科的发展,同时也对这些学科提出了新的挑战和要求。 本论文综述了生物信息学中若干问题的研究现状,介绍了生物信息学的基本概念,生物信息学主要的研究对象,研究目的及现有的研究进展。介绍了包括动态规划方法、数学统计方法、生物分子的计算机模式,计算智能技术等主要的生物信息学研究方法。着重介绍了生物信息学中计算智能的主要技术,分别为人工神经网络算法及遗传算法。 神经网络方法,是通过学习人脑的功能,对数据中所蕴含的信息和规律加以提取和识别,并通过对获得的信息进行学习和重新组织,结合专家经验,实现对问题的有效处理和解决。由于它的方法多样、适用于计算机计算以及预测精度好的特点,所以被大家广泛的研究应用于蛋白质二级结构预测中。而遗传算法是模拟生物在自然环境中的遗传和进化过程而形成的一种自适应全局优化概率搜索算法。遗传算法作为一种概率搜索算法,是一种自组织、自适应、自学习的智能化算法。它以决策变量的编码作为运算对象,以目标函数值作为搜索信息,强调概率转移规则,是讨论二维HP折叠模型的一种重要方法。本文主要介绍了人工神经网络在蛋白质二级结构预测中的应用,以及遗传算法在蛋白质折叠预测中的应用,通过对二者的研究,有利于更深入的了解生物信息学的智能算法及应用问题。

【关键词】:
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:Q811.4
【目录】:

下载全文 更多同类文献

CAJ全文下载

(如何获取全文? 欢迎:购买知网充值卡、在线充值、在线咨询)

CAJViewer阅读器支持CAJ、PDF文件格式


【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 何琴;高建华;刘伟;;蛋白质二级结构预测的人工神经网络方法研究[J];分析科学学报;2006年04期

2 陈颖健;生物信息学[J];国外科技动态;2002年10期

3 李小妹,王能超;神经网络预测蛋白质二级结构的编码技术[J];华中科技大学学报(自然科学版);2004年05期

4 王艳春;何东健;王守志;;基于级联神经网络的蛋白质二级结构预测[J];计算机工程;2010年04期

5 张海霞,唐焕文,张立震,靳利霞,唐一源;蛋白质二级结构预测方法的评价[J];计算机与应用化学;2003年06期

6 金丕彦,芮勇;BP算法各种改进算法的研究及应用[J];南京航空航天大学学报;1994年S1期

7 倪红春,王翼飞;基于遗传算法的蛋白质折叠模拟系统[J];上海大学学报(自然科学版);2001年04期

8 王秦虎;邓麟;韩翠芹;;人工神经网络预测蛋白质二级结构的编码技术综述[J];陕西农业科学;2007年06期

9 李军焘,刘来福;生物序列比对的数学模型及应用[J];数学的实践与认识;2005年01期

10 陈润生;生物信息学[J];生物物理学报;1999年01期

中国博士学位论文全文数据库 前4条

1 赵斌;生物数学的起源与形成[D];西北大学;2011年

2 董浩;RNA二级结构预测方法研究[D];吉林大学;2011年

3 王勇献;蛋白质二级结构预测的模型与方法研究[D];国防科学技术大学;2004年

4 宋杰;仿生计算在生物信息学中的应用[D];安徽大学;2006年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 高峰;遗传算法的若干理论分析[D];浙江大学;2003年

2 杨林美;一种改进的遗传算法在非线性规划中的应用[D];成都理工大学;2003年

3 景楠;基于神经网络方法蛋白质二级结构预测的研究[D];吉林大学;2004年

4 徐振东;人工神经网络的数学模型建立及成矿预测BP网络的实现[D];吉林大学;2004年

5 童琪薇;计算智能若干方法的应用研究[D];武汉理工大学;2005年

6 张原;分子系统学分析平台的建立和应用[D];中国科学院研究生院(植物研究所);2004年

7 闫化军;计算智能方法在生物信息学中的应用[D];电子科技大学;2005年

8 于思琦;粗糙集理论在蛋白质结构预测问题应用的研究[D];吉林大学;2005年

9 陈卫峰;蛋白质结构预测及其方法研究[D];武汉大学;2005年

10 王素华;基于遗传模拟退火算法的生物信息学双序列比对方法研究[D];东北师范大学;2006年

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 孙琳琳;蒋继志;李丽;;生物信息学及在农作物抗性基因研究中的应用[J];安徽农学通报;2006年10期

2 王艳春;何东健;;神经网络在蛋白质二级结构预测中的应用[J];安徽农业科学;2006年16期

3 王勇;陈克平;姚勤;;系统发生分析软件PAUP和TreePuzzle使用方法介绍[J];安徽农业科学;2008年02期

4 杨爽;刘家冈;;四足动物进化过程中的躯体拓扑稳定性[J];安徽农业科学;2008年10期

5 王勇;陈克平;姚勤;;系统发生分析程序MrBayes 3.1使用方法介绍[J];安徽农业科学;2009年33期

6 张卫平,吴兆麟;模糊神经元离散脉冲调宽技术的研究[J];北方工业大学学报;1998年03期

7 王琪;张伟;;城市环境质量定量评价方法[J];环境科学与管理;2006年02期

8 王雯雯;武栓虎;;基于DNA双链特征的启动子预测方法[J];北京交通大学学报;2009年06期

9 秦洋;王立宏;武栓虎;宋宜斌;;基于拉普拉斯矩阵的DNA序列集相似性分析[J];北京交通大学学报;2009年06期

10 张东亮,艾兴,张承瑞,许传俊;人工神经网络在运动控制中的应用[J];兵工自动化;2001年01期

中国重要会议论文全文数据库 前4条

1 胡扬;桂卫华;;人工代谢技术在医药领域中的应用研究[A];第二十九届中国控制会议论文集[C];2010年

2 杨长平;;生物信息学在畜禽基因组研究中的应用[A];中国农业信息科技创新与学科发展大会论文汇编[C];2007年

3 孙琳琳;蒋继志;;生物信息学及其在作物抗性基因研究中的应用[A];中国植物病理学会2006年学术年会论文集[C];2006年

4 郑伟文;刘波;;生物信息学与药用植物研究[A];全国中药材GAP研究与应用学术研讨会会议论文汇编[C];2004年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 刘文山;脂肪酶在酿酒酵母中的表面展示研究[D];华中科技大学;2010年

2 徐兆华;基因芯片数据统合分析方法的若干拓展[D];浙江大学;2010年

3 高翠芳;模糊聚类新算法及应用研究[D];江南大学;2011年

4 赵斌;生物数学的起源与形成[D];西北大学;2011年

5 张胜利;蛋白质与RNA中的若干问题研究[D];大连理工大学;2011年

6 刘晨光;氧化还原电位调控的高浓度乙醇发酵及其机理研究[D];大连理工大学;2011年

7 王立鹏;特征提取及分类算法在膜蛋白分类预测问题中的应用[D];兰州理工大学;2010年

8 刘念;三种蝗虫线粒体基因组测序与直翅目比较线粒体基因组学分析[D];陕西师范大学;2011年

9 许凌飞;基于炉口火焰光谱信息的转炉炼钢终点在线碳含量测量方法研究[D];南京理工大学;2011年

10 赵建邦;基于代谢网络的功能模式发现及系统发生分析研究[D];西安电子科技大学;2011年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 杨堃;鹅CYP7A1基因克隆、表达调节及表达规律的研究[D];华中农业大学;2010年

2 李红;苏云金芽胞杆菌YBT1520杀虫晶体突变株的蛋白质组学分析[D];华中农业大学;2010年

3 张杰;基于支持向量机和蛋白质全序列的蛋白质—蛋白质相互作用预测[D];郑州大学;2010年

4 吕俊杰;真核基因剪接位点识别算法研究[D];哈尔滨工程大学;2010年

5 刘翠;水声图像阈值分割及智能优化算法的研究[D];哈尔滨工程大学;2010年

6 张文俊;黑龙江科技学院学风预警管理信息系统研究[D];哈尔滨工程大学;2010年

7 史舵;基于主成分分析方法的蛋白质亚细胞定位[D];大连理工大学;2010年

8 张磊;人类复杂疾病基因编码区碱基突变特征分析[D];辽宁师范大学;2010年

9 战晓文;基于完全基因组且无序列比对的用于亲缘分析的严格距离度量[D];湘潭大学;2010年

10 王若飞;基于机器学习的蛋白质折叠预测算法研究[D];湘潭大学;2010年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 唐永成,曹静平,高章红;安徽东部地区金矿资源GIS评价[J];安徽地质;2000年02期

2 王全;混合遗传算法及其改进[J];安徽建筑工业学院学报(自然科学版);1999年04期

3 王艳春;何东健;;神经网络在蛋白质二级结构预测中的应用[J];安徽农业科学;2006年16期

4 冯守平,张洪,洪文;切割问题及其数学模型[J];安徽技术师范学院学报;2005年04期

5 阮晓钢,孙海军;编码方式对蛋白质二级结构预测精度的影响[J];北京工业大学学报;2005年03期

6 裴旭东,黄聪明;对象输入参数优化的人工神经网络方法[J];北京理工大学学报;2000年01期

7 夏仁强;;多种群自适应模拟退火遗传算法求解TSP问题[J];毕节学院学报;2008年04期

8 陈小野,邹世洁;中医学中的概率统计原理[J];北京中医;1987年06期

9 毛长飞;顾乾屏;陈坚;罗升平;;基于有吸收态的马尔可夫链的贷款迁移分析[J];山东工商学院学报;2007年05期

10 孟庆云;中医学方法论第四讲 数学方法在中医学中的应用[J];中国医药学报;1987年03期

中国重要会议论文全文数据库 前1条

1 毛树春;李亚兵;王香河;韩迎春;王国平;范正义;;我国棉花产业经济预警系统的重大技术支持——《中国棉花生产景气报告》简介[A];中国棉花学会2004年年会论文汇编[C];2004年

中国博士学位论文全文数据库 前4条

1 张持健;商空间下模糊系统与模糊控制的问题求解[D];安徽大学;2005年

2 刘海军;RNA二级结构预测的建模及其应用研究[D];上海大学;2005年

3 刘琦;RNA二级结构的若干计算生物学问题研究[D];浙江大学;2008年

4 何静媛;RNA二级结构预测算法的研究[D];重庆大学;2009年

中国硕士学位论文全文数据库 前8条

1 汪明磊;基于神经网络的鸡病诊断专家系统的研究与建立[D];安徽农业大学;2001年

2 刘燕;储粮昆虫图像模式识别研究[D];成都理工大学;2002年

3 张法全;基于机器视觉和小波分析的农田害虫识别系统[D];郑州大学;2003年

4 王新东;一维多材料下料问题的研究与应用[D];中国地质大学(北京);2007年

5 陆健;基于动态权重匹配的RNA二级结构预测算法[D];江苏大学;2007年

6 李誌;基于马尔科夫链的RNA二级结构预测[D];吉林大学;2007年

7 彭政;带假结的RNA二级结构预测算法研究[D];湖南大学;2008年

8 夏培明;RNA二级结构预测算法的研究与实现[D];哈尔滨工业大学;2008年

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 胡桂武;曾岫;黄辉;;基于模拟退火遗传算法的多序列比对方法[J];吉首大学学报(自然科学版);2005年04期

2 童庆;郑浩然;宁岩;王煦法;;一种用于基因5’exons预测的新方法[J];北京生物医学工程;2007年01期

3 郭雨珍;冯恩民;;蛋白质结构研究现状与展望[J];生物信息学;2007年04期

4 吴旻;发展基因组学和生物信息学刻不容缓[J];中国科技月报;1999年12期

5 刘晓,施锐,张士璀,戴桂林;生物信息学与生物经济[J];生物学杂志;2004年04期

6 郑伟国,郭英,常春艳;生物信息学的现状与未来[J];口岸卫生控制;2004年05期

7 ;科学出版社生命科学编辑部新书推介[J];中国生物工程杂志;2005年04期

8 崔向军;;生物信息学在DNA局域结构研究中的应用[J];内蒙古科技与经济;2006年24期

9 李强;胡志东;;蛋白质组学技术研究[J];医学综述;2007年11期

10 ;生物信息学试题答案(2)[J];外科理论与实践;2007年04期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 冯文龙;赵清杰;;基于遗传算法的DNA多序列比对问题[A];2007年中国智能自动化会议论文集[C];2007年

2 李媛;崔尚金;李建伟;于康震;;分子生态学与生物信息学[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十一次学术研讨会论文集[C];2002年

3 陆文聪;钮冰;;基于数据挖掘的生物信息学研究进展[A];中国化学会第27届学术年会第15分会场摘要集[C];2010年

4 陈婷婷;郭婷婷;李林;安冬;;基于生物信息学的功能蛋白基因序列分类研究[A];2011年全国通信安全学术会议论文集[C];2011年

5 卢学春;杨波;朱宏丽;姚善谦;;采用生物信息学方法优化依硫磷酸联合方案治疗MDS的应用研究[A];中国科协海峡两岸学术研讨会——2008血液肿瘤论坛会议会编[C];2008年

6 阮林;何颖;邹泽红;傅意玲;陈惠芳;陶爱林;;外源蛋白过敏原性生物信息学评价[A];中华医学会2010年全国变态反应学术会议暨中欧变态反应高峰论坛参会指南/论文汇编[C];2010年

7 康晓东;;生物信息学及其研究对象[A];2003年全国医学影像技术学术会议论文汇编[C];2003年

8 王智宇;童强松;曾甫清;刘媛;顾朝辉;郑丽端;蔡嘉斌;蒋国松;;小鼠睾丸特异性基因TSEG-4的克隆及表达分析[A];第十五届全国泌尿外科学术会议论文集[C];2008年

9 武妍;潘勇;施鸿宝;;模糊神经网络学习算法及其在地铁列车控制中的应用[A];1999年中国神经网络与信号处理学术会议论文集[C];1999年

10 朱云平;刘湘军;魏丽萍;李亦学;;肝脏蛋白质组的生物信息学研究[A];中国蛋白质组学第三届学术大会论文摘要[C];2005年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 本报记者 李恩青;[N];中国高新技术产业导报;2001年

2 刘义;[N];中国高新技术产业导报;2000年

3 英潮;[N];中药报;2002年

4 中科院院士 强伯勤;[N];光明日报;2002年

5 白毅;[N];中国医药报;2002年

6 周颖;[N];中国中医药报;2006年

7 中国科学院院士 张春霆 郝柏林;[N];经济日报;2000年

8 刘丽丽;[N];计算机世界;2007年

9 严飞;[N];大众科技报;2002年

10 张亚东;[N];计算机世界;2002年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 焦嵩鸣;计算智能及其在热工系统中的应用研究[D];华北电力大学(河北);2007年

2 彭司华;计算智能在生物信息学中的应用研究[D];浙江大学;2004年

3 张敏;生物信息学中多序列比对等算法的研究[D];大连理工大学;2005年

4 曾智勇;猪呼肠孤病毒SC-A株的分离鉴定及全基因组cDNA文库的构建和分子遗传特征分析[D];四川农业大学;2006年

5 肖庆;硬粒小麦硒蛋白的生物信息学研究[D];华中科技大学;2008年

6 张革新;α-淀粉酶性能与结构关系的生物信息学研究[D];江南大学;2005年

7 李艳芸;HLA-DRB1基因编码区SNPs的分析及其与宫颈癌的相关性研究[D];天津医科大学;2006年

8 童庆;面向基因预测的信息处理方法研究[D];中国科学技术大学;2006年

9 刘立芳;生物信息学中的多序列比对与模体识别问题研究[D];西安电子科技大学;2006年

10 郭雨珍;蛋白质结构预测和比较的优化研究[D];大连理工大学;2007年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 郭俊恩;蚁群遗传算法在序列比对中的应用[D];江南大学;2008年

2 司徒浩臻;基于遗传算法的多序列比对算法研究[D];暨南大学;2006年

3 张忆;基于遗传退火的生物信息学多序列比对算法研究[D];电子科技大学;2009年

4 胡永钢;序列联配的算法比较与机器学习在其中的应用研究[D];江南大学;2005年

5 梁云静;基于遗传算法的主题爬虫搜索策略研究[D];湖北工业大学;2010年

6 李振业;多向变异遗传算法及其优化神经网络的研究[D];华南理工大学;2011年

7 朱奉梅;遗传算法在高校排课系统中的研究与应用[D];东北大学;2009年

8 孙晓丽;基于遗传算法的既有线平面及纵断面整正优化设计[D];中南大学;2010年

9 冯秋霞;解最小生成树问题的新的遗传算法[D];西安电子科技大学;2010年

10 郭佳;基于遗传算法的认知无线网络资源分配技术研究[D];西安电子科技大学;2010年


  本文关键词:计算智能若干方法的应用研究,由笔耕文化传播整理发布。



本文编号:52651

资料下载
论文发表

本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/rengongzhinen/52651.html


Copyright(c)文论论文网All Rights Reserved | 网站地图 |

版权申明:资料由用户0c510***提供,本站仅收录摘要或目录,作者需要删除请E-mail邮箱bigeng88@qq.com