桃小食心虫在我国主要发生区的种群遗传结构

发布时间：2025-05-08 03:30

　　桃小食心虫Carposina sasakii(Matsumura)又名桃蛀果蛾,属鳞翅目Lepidoptera蛀果蛾科Carposinidae,是我国果树生产中为害最严重的蛀果类害虫之一。迄今,有关桃小食心虫是否存在寄主相关性遗传分化尚有待证实,且该害虫在我国不同地理种群间的遗传结构尚不清楚。为此,本研究利用开发获得的微卫星分子标记和已经报道的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COXI)基因两种分子标记探究了桃小食心虫在我国主要发生区的寄主相关性种群和地理种群的遗传结构,并分析了影响遗传结构的因素。主要研究结果如下:(1)桃小食心虫微卫星标记开发利用Illumina Miseq高通量测序平台对桃小食心虫进行基因组测序,获得4.70 GB原始测序数据,组装得到479 Mb基因组随机序列。基于桃小食心虫基因组随机序列搜索得到95,153个微卫星位点,其中重复单元为2碱基的数量最多(57.34%)。挑选了64个位点进行初步扩增效果和多态性分析,有35个位点表现较好。利用来自北京和湖北的2个桃小食心虫种群(63个个体)对35个微卫星位点进行遗传多样性检验,发现微卫星位点等位基因数量范围为2～9个,平均...

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【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
1 前言
    1.1 桃小食心虫的分布与危害
    1.2 寄主植物对桃小食心虫生物学的影响
        1.2.1 寄主植物对桃小食心虫生长发育、存活和繁殖的影响
        1.2.2 寄主植物对桃小食心虫滞育、发生世代的影响
        1.2.3 寄主植物对桃小食心虫出土、交配、产卵习性的影响
    1.3 植食性昆虫种群遗传分化的影响因素
        1.3.1 寄主植物对植食性昆虫遗传分化的影响
        1.3.2 地理隔离对植食性昆虫遗传分化的影响
        1.3.3 历史事件对植食性昆虫遗传分化的影响
    1.4 桃小食心虫种群遗传结构研究进展
        1.4.1 寄主相关性种群遗传分化研究概况
        1.4.2 地理种群遗传结构研究概况
    1.5 昆虫群体遗传结构研究的分子标记技术
        1.5.1 RFLP
        1.5.2 RAPD
        1.5.3 AFLP
        1.5.4 mtDNA
        1.5.5 SSR
        1.5.6 SNP
    1.6 本研究的目的及意义
2 材料与方法
    2.1 试验仪器与试剂
        2.1.1 试验仪器
        2.1.2 试验试剂和试剂盒
    2.2 试验方法
        2.2.1 样本的采集与鉴定
        2.2.2 DNA提取与保存
        2.2.3 基因组随机序列的测定
        2.2.4 微卫星引物设计
        2.2.5 引物筛选及多态性检验
        2.2.6 微卫星分型和线粒体序列测序
        2.2.7 PCR产物电泳检测
    2.3 数据统计分析
        2.3.1 微卫星开发的数据分析
        2.3.2 种群遗传结构及其影响因素分析
3 结果与分析
    3.1 桃小食心虫微卫星标记开发
        3.1.1 基因组随机序列
        3.1.2 微卫星位点分布
        3.1.3 微卫星位点特征
    3.2 桃小食心虫种群遗传结构及其影响因素
        3.2.1 种群遗传多样性
        3.2.2 微卫星分子标记分辨率和无效等位基因对遗传差异分析的影响..
        3.2.3 种群遗传结构
        3.2.4 遗传分化与环境因子和地理距离间的相关性
        3.2.5 单倍型网状图与分化时间
        3.2.6 扩散路径
4 结论与讨论
    4.1 结论
    4.2 讨论
        4.2.1 桃小食心虫的种群遗传分化
        4.2.2 历史事件对桃小食心虫种群分化的影响
        4.2.3 地理隔离与环境因子对桃小食心虫种群分化的影响
参考文献
导师简介
个人简介
致谢



本文编号：4044248