胡杨PeuAZF2基因的克隆和功能分析

发布时间：2025-05-06 22:36

　　C2H2型锌指蛋白(C2H2-ZFPs)是植物中一类非常重要的转录因子家族,不仅调节植物的生长发育,而且参与植物多种生物和非生物胁迫响应。本研究以抗逆模式林木树种—胡杨为研究对象,通过blast以及Pfam鉴定,从胡杨基因组中鉴定出78个编码C2H2-ZFPs的基因,对其中的Peu AZF2基因进行了克隆鉴定以及转基因异源表达分析,主要研究结果如下:(1)系统进化分析:根据拟南芥C2H2型锌指转录因子家族的基因序列,在胡杨基因组中blast其同源序列,并使用Pfam进一步确认锌指功能结构域,最终鉴定出78个胡杨C2H2-ZFP基因,含有1～5个锌指结构域,被长度不同的间隔区分开。基于胡杨C2H2-ZFP基因序列构建NJ树,发现胡杨78个C2H2-ZFP基因可以分为4组(I、II、III和IV),分别包含3,15,33,27个基因成员,每组之间基因的外显子数量保守,但锌指结构域数量和保守motif数量差异显著。系统发育分析发现,Peu AZF2、新疆杨PalAZF2以及拟南芥At AZF2基因属于直系同源基因。(2)杨树AZF2基因结构分析和功能预测:转录组数据显示,胡杨PeuAZF2在盐...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1.1锌指结构域结构图

3的亲和力。图1.1锌指结构域结构图Figure1.1ThestructureofzincfingerdomainA.C2H2型锌指结构(赵丽娟等,2016)；B.C2H2型锌指空间结构(ThomasSplettstoesser)。除了ZF结构域，C2H2-....

图1.3C2H2锌指蛋白与DNA双螺旋作用的空间结构图

胡杨PeuAZF2指蛋白与DNA的结合蛋白依靠其指型空间结构伸入到DNA双螺旋的与DNA的碱基形成反向平行的特异性接触，DNA的5’端，所有的碱基特异性接触都位于D过电泳凝胶迁移率可以分析不同的C2H2型锌作用原件的结合特异性。以往的研究通过凝胶迁的拟南芥C2H2型锌指蛋白，AZ....

图3.1胡杨C2H2锌指基因的分类，基因结构和motif分析

36图3.1胡杨C2H2锌指基因的分类，基因结构和motif分析Figure3.1Theclassification,genestructureandmotifdistributionofC2H2-ZFPgenesinPopuluseuphr....

图3.2胡杨C2H2锌指基因的染色体定位Figure3.2ChromosomallocationsofPeuZFPgenesinPopuluseuphratica

位于第Ⅳ组PeuZFP基因且富含保守的motif（图3.1），定位在第9号染色体上（图3.2）。转录组分析发现它在盐胁迫下表达水平显著上调，我们猜测PeuAZF2可能

本文编号：4043192