利用四交RIL群体定位小麦籽粒脱水速率QTL
发布时间:2025-05-01 11:22
为了探索小麦生理成熟后籽粒脱水速率的遗传机制,以扬麦16、镇麦168、扬麦20和扬麦22为亲本构建四亲本RIL群体,利用小麦15K SNP芯片构建其遗传连锁图谱,并对小麦籽粒脱水速率QTL进行定位。结果共检测到12个与小麦籽粒脱水速率相关的QTL,分布在1AL(2)、2AL、3BS、3BL、4AS、5BL、6DL、7AL、7BS、7BL和7DS,其中 QDR-yaas-6DL、 QDR-yaas-1AL.1和 QDR-yaas-3BL脱水速率增效基因仅来自扬麦16,可分别解释表型变异的8.1%、7.6%和2.8%; QDR-yaas-1AL.2, QDR-yaas-2AL, QDR-yaas-4AS和 QDR-yaas-7DS脱水速率增效基因仅来自镇麦168,可解释表型变异的3.6%~4.2%; QDR-yaas-5BL脱水速率增效基因仅来自扬麦20,可解释表型变异的5.4%; QDR-yaas-3BS和 QDR-yaas-7BS脱水速率增效基因来自扬麦20和扬麦16,可解释表型变异的3.2%和3.8%; QDR-yaas-7AL和 QDR-yaas-7BL脱水速率增效基因来自镇麦16...
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本文编号:4042195
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图1 群体的主成分分析结果
过滤15KSNP基因型数据,最终在群体中得到2761个高质量SNP位点用于群体结构分析,主成分分析结果表明,群体的PC1和PC2分别是5.9%和5.8%,没有表现出明显的群体结构(图1)。2.3连锁作图
图2 四交RIL群体定位脱水速率QTL结果
共检测到12个与脱水速率显著相关的QTL(图2,表3),将连锁标记序列与中国春的EnsemblPlants数据库(http://plants.ensembl.org/)参考基因组序列进行比对,发现12个QTL分布在1AL(2)、2AL、3BS、3BL、4AS、5BL、6DL、7A....
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