文献计量学结合主题建模及生物信息学分析:肝癌免疫治疗的进展和新型标记物研究
发布时间:2025-08-19 12:34
目的:肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是导致癌症相关死亡的第三大最常见的原因,在发病率方面排名第六。近年来,免疫治疗在肝癌上出现了突破性的进展,此类相关文献大量应运而生,然而与此相关的计量学信息特征仍然未知。因此,我们以此为契机,对肝癌免疫治疗的进展进行文献计量学和主题建模的分析(第一部分),并使用文献计量学分析方法筛选出的热门基因进行下一部分的研究,探索肝癌预后不良的独立预测因子,刻画免疫状态以及评估免疫微环境和免疫疗效(第二部分)。研究方法:在基于文献计量学和主题建模的肝癌免疫治疗的进展研究部分(第一部分),本研究从web of Science核心数据集下载了2000-2020年肝癌免疫治疗研究领域的研究性文献或综述类文章。最终共纳入3186篇文章,分别以txt、csv格式导出。应用VOSviewer1.6.15和R-bibliometrix绘制作者之间、国家之间和机构之间的合作网络以及进行期刊分析,Citespace5.7.R1进行文献共被引网络和突发性检测分析,“pyecharts”包可视化国家发文量地图。同时结合潜在狄利克雷分配(Latent D...
【文章页数】:99 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
英文缩略词
第一部分:基于文献计量学和主题建模的肝癌免疫治疗的进展研究
1 前言
2 材料和方法
2.1 基于文献计量学分析的肝癌免疫治疗研究现状与历史演变的研究
2.1.1 数据来源和检索策略
2.1.2 纳入标准和排除标准
2.1.3 数据下载和质量评价
2.1.4 数据分析
2.2 基于主题建模的肝癌免疫治疗热点问题与前沿趋势的研究
2.2.1 LDA主题建模
2.2.2 BERT主题建模
2.2.3 统计学分析
3 结果
3.1 基于文献计量学分析的肝癌免疫治疗研究现状与历史演变的研究
3.1.1 检索结果
3.1.2 出版物年度分析
3.1.3 研究力量
3.1.4 研究合作
3.1.5 期刊分析
3.1.6 历史直接引文网络
3.1.7 参考文献共被引分析
3.1.8 突发性检测
3.2 基于主题建模的肝癌免疫治疗热点问题与前沿趋势的研究
3.2.2 LDA生成的主题和类别
3.2.3 LDA结果综合
3.2.4 BERTopic主题模型
3.2.5 Topic2Vector主题模型
4 讨论
5 结论
第二部分:基于生物信息学分析的肝癌免疫治疗的新型标记物的研究
1 前言
2 材料和方法
2.1 基因筛选
2.2 数据采集
2.3 ADAM9预后和临床特征的评估
2.4 荟萃分析
2.5 ADAM9与肿瘤浸润免疫细胞的相关性
2.6 功能富集分析
2.7 免疫治疗疗效分析
2.8 统计分析
3 结果
3.1 热门研究基因
3.2 ADAM9的表达与临床参数之间的关联
3.3 荟萃分析
3.4 功能富集分析
3.5 免疫状态和肿瘤微环境分析
3.6 ADAM9表达在预测HCC免疫治疗反应中的潜在作用
4 讨论
5 结论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述 肝细胞癌免疫治疗的研究进展与展望
参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简历
本文编号:4059207
【文章页数】:99 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
英文缩略词
第一部分:基于文献计量学和主题建模的肝癌免疫治疗的进展研究
1 前言
2 材料和方法
2.1 基于文献计量学分析的肝癌免疫治疗研究现状与历史演变的研究
2.1.1 数据来源和检索策略
2.1.2 纳入标准和排除标准
2.1.3 数据下载和质量评价
2.1.4 数据分析
2.2 基于主题建模的肝癌免疫治疗热点问题与前沿趋势的研究
2.2.1 LDA主题建模
2.2.2 BERT主题建模
2.2.3 统计学分析
3 结果
3.1 基于文献计量学分析的肝癌免疫治疗研究现状与历史演变的研究
3.1.1 检索结果
3.1.2 出版物年度分析
3.1.3 研究力量
3.1.4 研究合作
3.1.5 期刊分析
3.1.6 历史直接引文网络
3.1.7 参考文献共被引分析
3.1.8 突发性检测
3.2 基于主题建模的肝癌免疫治疗热点问题与前沿趋势的研究
3.2.2 LDA生成的主题和类别
3.2.3 LDA结果综合
3.2.4 BERTopic主题模型
3.2.5 Topic2Vector主题模型
4 讨论
5 结论
第二部分:基于生物信息学分析的肝癌免疫治疗的新型标记物的研究
1 前言
2 材料和方法
2.1 基因筛选
2.2 数据采集
2.3 ADAM9预后和临床特征的评估
2.4 荟萃分析
2.5 ADAM9与肿瘤浸润免疫细胞的相关性
2.6 功能富集分析
2.7 免疫治疗疗效分析
2.8 统计分析
3 结果
3.1 热门研究基因
3.2 ADAM9的表达与临床参数之间的关联
3.3 荟萃分析
3.4 功能富集分析
3.5 免疫状态和肿瘤微环境分析
3.6 ADAM9表达在预测HCC免疫治疗反应中的潜在作用
4 讨论
5 结论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述 肝细胞癌免疫治疗的研究进展与展望
参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简历
本文编号:4059207
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