榧树基因组SSR分子标记开发

发布时间：2025-07-02 04:39

　　基于榧树(Torreya grandis)基因组DNA测序数据开发SSR分子标记,利用MISA和Primer 3.0脚本设计SSR引物,从中选择合成20对SSR引物并在10个榧树品种中进行多态性扩增,其中6对引物成功扩增并鉴定到多态性,各个位点的等位基因数量介于4～9个之间,平均等位基因数约为6个,多态信息含量PIC平均值为1.779 2。本研究开发的SSR引物能为榧树遗传多样性研究、品种指纹图谱构建提供依据。

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【部分图文】：

图1 基于SSR分子标记分型产生的10份榧树试材聚类树

基于6对SSR引物的分型结果并采用UPGMA法构建10个榧树品种的遗传亲缘关系聚类树(图1)。当遗传相似系数约为0.73时,可将所有试材分为3个组。A组包含有4个榧树品种,其中包括细榧和茄榧。B组和C组分别包含有3个榧树品种,其中,B组包括著名榧树类型珍珠榧和两个榧树雄株,意味着....