狗枣猕猴桃AkKCS蛋白的生物信息学分析

发布时间：2025-06-27 04:36

　　 为深入研究狗枣猕猴桃AkKCS蛋白功能,利用生物信息学方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性和功能结构域进行分析。结果表明:狗枣猕猴桃AkKCS蛋白cDNA全长为1 693bp,共编码496个氨基酸,为亲水性、不稳定蛋白质,具有KCS超家族的保守结构域(ID:PLN03212),AkKCS氨基酸序列与中华猕猴桃原变种亲缘关系较近,与烟草等12种其他植物亲缘关系较远。

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【部分图文】：

图1 狗枣猕猴桃AkKCS蛋白的等电点

对AkKCS氨基酸序列预测结果表明，AkKCS蛋白开放阅读框为1693bp，编码496个氨基酸，分子式为C2533H4038N680O691S28，分子量55971Da，理论pI为9.33，不稳定指数为40.75，脂肪系数为99.07，亲水性平均水平0.011。AkKCS蛋白....

图2 狗枣猕猴桃AkKCS蛋白的跨膜结构预测

NCBI-CDD序列的比对结果（图3）表明，狗枣猕猴桃AkKCS蛋白为3-酮脂酰-CoA合酶KCS基因家族的成员（ID:PLN03212）之一，其保守结构域及功能位点位于第80～454氨基酸之间的序列区域，第80～368氨基酸之间含有FAE1合酶保守结构及其他查尔酮合酶保守结构域....

图3 狗枣猕猴桃AkKCS蛋白的保守序列

图2狗枣猕猴桃AkKCS蛋白的跨膜结构预测2.4AkKCS蛋白的二级、三级结构预测

图4 狗枣猕猴桃AkKCS蛋白的三级结构预测

对AkKCS蛋白的二级结构预测结果表明，螺旋（Helix）为该蛋白的主要结构，占比50.2%；无规卷曲（Randomcoil）占比31.45%，延伸链（Strand）占比13.31%,5.04%为转角（Turn）结构，没有特殊结构。对AkKCS蛋白三级结构预测结果（图4）表明，....

本文编号：4053818