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外显子测序探索结直肠侧向发育型肿瘤体细胞突变的研究

发布时间:2021-07-11 06:23
  研究背景和目的结直肠侧向发育型肿瘤(laterally spreading tumor,LST)是直径大于lcm,生长方式为侧向生长而非垂直生长的表浅病变,其形态可以分为颗粒均一型、结节混合型、平坦隆起型、假凹陷型。研究显示,近年来LST的检出率有明显的上升趋势。LST是一种重要的癌前疾病,其高级别上皮内瘤变及粘膜下浸润率高达45%~79%,有潜在的癌变风险。由于缺少相应的细胞系,LST相关分子机制研究甚少,其发生发展机制仍不明确。结直肠癌的发生主要来源于腺瘤-癌途径,该过程包含了复杂的分子变化。基因作为遗传物质和蛋白质转录翻译的来源,其改变在肿瘤形成和发展过程中占据重要地位。研究证实体细胞突变可以导致蛋白质表达量或功能变化。研究肿瘤的体细胞突变是揭示其发生发展机制的重要一步。目前,基于二代测序技术的体细胞研究已经应用于大多数的肿瘤,揭示了大量的突变基因。研究者通过多种算法和模型对基因数据进行深入挖掘,寻找高频突变基因、肿瘤突变特征、突变通路、显著突变网络等,是理解肿瘤发生发展机制的有效手段之一。Luke B.Hesson等人曾对LST进行外显子测序研究,但其纳入样本主要为低级别瘤变样... 

【文章来源】:南方医科大学广东省

【文章页数】:71 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

外显子测序探索结直肠侧向发育型肿瘤体细胞突变的研究


图1-5各例LST中96中突变组合中的分布??Figure?1-5?Fhe?mutation?spectra?across?96?mutational?channels?of?each??

突变型,测序,样本,野生型


?第二章Sanger测序及验证???A??GNAS?R186H?GNAS?R186C?Wild?Type??■?■?■?-?-?.?■?■_?■_?■■■■■_■??TGCCnTG?TGCnGTG?TGCCGTG??ti?ri?wl??B?C??p<O.OB?p=0.11??100?100-??1?■?I?1?_??"5〇-?rin?P?N?L??辛?i?丁丁??■?i???'??wild?type?mutant?wild?type?mutant??图2-1?Sanger测序及突变型与野生样本肿瘤大小比较??Figure?2-1?Sanger?sequence?and?comparison?of?tumor?size?of?wild?type?and?mutant?LST??A.?Sanger测序示野生型样木为单峰而突变型样本在指定位点出现双峰;B.野生型与突变型??LST大小有显著差笄,突变型大了?野生型(p<〇.〇5);?C.在直肠绒毛状腺瘤或管状绒毛状腺??瘤样本中,突变型LST肿瘤大小大于野生型,但差异并无统计学意义(p=0.11)??48??

【参考文献】:
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本文编号:3277523

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