IGF2、IGFBP2和DRD2基因遗传变异与番鸭产蛋性能的相关性研究

发布时间：2017-04-11 03:01

  本文关键词：IGF2、IGFBP2和DRD2基因遗传变异与番鸭产蛋性能的相关性研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：番鸭是优良的肉用家禽,深受养户和消费者的喜爱,但番鸭的育成时间长、饲养成本高,产蛋数较少,降低了番鸭的利用价值,所以番鸭的优质性状还有待发掘,特别是产蛋性状的选育,更是育种工作的难点。传统的育种方法很难对产蛋性状做出精确的选择,这就要求我们从育种分子标记入手。本试验选用IGF2,IGFBP2和DRD2基因为研究对象,扩增这些基因的CDS区,研究它们在番鸭各个组织的表达规律,筛选它们的多态位点,并探寻这些SNP与番鸭产蛋性状的相关性。本实验获得番鸭IGFBP2和DRD2的全长CDS区序列及IGF2基因的部分CDS区序列。检测这三个基因在番鸭各个组织中的表达规律,发现番鸭IGF2基因主要在肾脏和卵巢表达,在心脏、肝脏、大脑、小脑、垂体和腹脂也有较高表达;IGFBP2基因主要在心脏有表达;而DRD2基因主要在卵巢和脑部组织中表达。并且发现这三个基因在卵巢组织都有相当高的表达水平,因此猜想这三个基因可能与繁殖性状有一定的相关性。在IGF2,IGFBP2和DRD2基因中共发现50个SNP,分析其中19个SNP位点与产蛋性状的关系发现,IGF2基因的A-1864G和C-1704G位点多态性都与59周龄产蛋量显著相关(P0.05),而对开产日龄和300日龄产蛋数影响不显著(P0.05),而且2个位点的等位基因频率符合哈迪温伯格平衡;IGFBP2基因的6个SNP位点与开产日龄、59周龄产蛋量和300日龄产蛋量都没有显著相关(P0.05),但不同基因型之间还是存在一定差异,且6个SNP的等位基因频率符合哈迪温伯格平衡;DRD2基因C+7T、A+3183C、C+3301G、A+3484T和A+3489G位点都与59周龄产蛋量显著相关(P0.05),T+3423C位点与59周龄产蛋量极显著相关(P0.01);C+7T、C+364G和T+3423C位点与开产日龄显著相关(P0.05),且T+3423C位点与300日龄产蛋量显著相关(P0.05),除了C+7T和C+364G位点,其他位点都偏离了哈迪温伯格平衡。本试验在IGF2,IGFBP2和DRD2基因中鉴定与产蛋性状显著相关的多态位点,可以用于对番鸭产蛋性状进行分子标记辅助选择。
【关键词】：番鸭 产蛋性状 IGF2 IGFBP2 DRD2
【学位授予单位】：华南农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S834
【目录】：

• 摘要3-4
• Abstract4-6
• 常用缩写词6-10
• 1 前言10-16
• 1.1 我国水禽产业生产现状10
• 1.2 SNP在畜禽育种中的作用10-11
• 1.3 IGFs系统的组成及作用途径11-15
• 1.3.1 IGF2的结构与功能12-13
• 1.3.2 IGFBP2的结构和功能13-14
• 1.3.3 IGFs对卵泡发育的影响14-15
• 1.4 DRD2的结构和功能15-16
• 1.5 本研究的目的和意义16
• 2 材料和方法16-28
• 2.1 试验动物16
• 2.2 主要仪器设备16-17
• 2.3 主要试剂来源及配制17-18
• 2.3.1 主要试剂来源17
• 2.3.2 主要试剂配制17-18
• 2.4 试验方法18-28
• 2.4.1 基因组DNA的提取18
• 2.4.2 DNA浓度和纯度的检测18
• 2.4.3 总RNA的抽提与检测18-19
• 2.4.4 RNA的反转录19-20
• 2.4.5 IGF2、IGFBP2和DRD2基因CDS克隆20-23
• 2.4.5.1 引物设计合成20-21
• 2.4.5.2 PCR产物回收与纯化21-22
• 2.4.5.3 回收纯化后的PCR产物克隆测序22-23
• 2.4.6 IGF2、IGFBP2和DRD2基因的组织表达23-24
• 2.4.6.1 定量引物设计合成23-24
• 2.4.6.2 荧光定量的计算分析方法24
• 2.4.7 SNP位点的筛查24-26
• 2.4.7.1 DNA池的构建24
• 2.4.7.2 SNP位点筛查引物的设计合成24-25
• 2.4.7.3 混池反应体系25-26
• 2.4.8 SNP位点分型26-27
• 2.4.8.1 SNP位点分型引物的设计合成26-27
• 2.4.8.2 SNP位点直接测序分型27
• 2.4.9 数据分析27-28
• 2.4.9.1 变异位点的筛查27
• 2.4.9.2 关联分析27-28
• 3 结果与分析28-50
• 3.1 番鸭IGF2、IGFBP2和DRD2基因CDS的克隆28-33
• 3.1.1 组织RNA的提取和反转录28
• 3.1.2 番鸭IGF2基因部分CDS的克隆28-29
• 3.1.3 番鸭IGFBP2基因CDS的克隆29-30
• 3.1.4 番鸭DRD2基因CDS的克隆30
• 3.1.5 番鸭IGF2、IGFBP2和DRD2基因序列比对和同源性分析30-33
• 3.2 番鸭IGF2、IGFBP2和DRD2基因的组织表达33-35
• 3.2.1 IGF2基因的m RNA在番鸭各组织中的表达33
• 3.2.2 IGFBP2基因的m RNA在番鸭各组织中的表达33-34
• 3.2.3 DRD2基因的m RNA在番鸭各组织中的表达34-35
• 3.3 番鸭IGF2、IGFBP2和DRD2基因的SNP位点的筛查35-38
• 3.3.1 番鸭IGF2基因的SNP位点的筛查35
• 3.3.2 番鸭IGFBP2基因的SNP位点的筛查35-36
• 3.3.3 番鸭DRD2基因的SNP位点的筛查36-38
• 3.4 番鸭IGF2、IGFBP2和DRD2基因SNP位点的关联分析38-43
• 3.4.1 番鸭IGF2基因SNP位点与产蛋性状的关联分析38-39
• 3.4.2 番鸭IGFBP2基因SNP位点与产蛋性状的关联分析39-40
• 3.4.3 番鸭DRD2基因SNP位点与产蛋性状的关联分析40-43
• 3.5 基因型频率和基因频率的计算和H-W检测43-50
• 3.5.1 IGF2基因SNP位点的基因型频率、基因频率和H-W检测43-44
• 3.5.2 IGFBP2基因SNP位点的基因型频率、基因频率和H-W检测44-46
• 3.5.3 DRD2基因SNP位点的基因型频率、基因频率和H-W检测46-50
• 4 讨论50-56
• 4.1 番鸭IGF2、IGFBP2和DRD2基因的结构分析50-51
• 4.2 番鸭IGF2、IGFBP2和DRD2基因的组织表达分析51-52
• 4.3 SNPs与相关产蛋性状的关联分析52-55
• 4.3.1 IGF2基因SNPs与相关产蛋性状的关联分析52-53
• 4.3.2 IGFBP2基因SNPs与相关产蛋性状的关联分析53-54
• 4.3.3 DRD2基因SNPs与相关产蛋性状的关联分析54-55
• 4.4 SNPs位点等位基因和基因型频率分布55-56
• 5 结论56-57
• 致谢57-58
• 参考文献58-65

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

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本文编号：298138