不同地区沙田柚果园土壤细菌群落结构和多样性分析

发布时间：2025-06-28 05:28

　　 【目的】明确不同地区沙田柚果园土壤细菌群落结构及多样性,为沙田柚栽培的精准管理提供参考。【方法】以5省(市)7县沙田柚果园土壤为研究对象,测定土壤理化性质,应用高通量测序研究其多样性及群落结构。【结果】研究合计获得可用于物种分类的OTUs 10 713条,至少涵盖60门,68纲,147目,275科,658属;多样性分析表明,长寿的样本多样性最低,连山的样本多样性最高;变形菌门是所有样本中的优势菌门;Sphingomonas sp.是沙田柚栽培产区潜在的致病小种;对土壤理化性质分析发现,不同来源的样本土壤理化性质差异较大;冗余分析发现,80.55%的群落变化可以被选取的环境因素所解释。【结论】硝态氮、无机磷、速效钾3个因素是影响细菌α多样性的主要因素,不同区域的沙田柚果园细菌种群不同。

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【部分图文】：

图1 取样点分布图

采用SDS法提取土壤总DNA，琼脂糖凝胶电泳检测DNA的纯度和浓度后，将稀释DNA浓度稀释至样本，终浓度为1ng/μL。扩增引物使用带Barcode的细菌16SrDNA-V4区特异引物（515F和806R，引物序列分别为GTGCCAGCMGCCGCGGTAA和GGACTAC....

图2 各样本的稀释曲线

利用花瓣图分析均一化处理后的各组样本之间共有、特有的OTUs。如图所示，合计969个OTUs为7个不同地区沙田柚果园所共有，特有OTUs最多的是连山的样品，特有OUTs数为645；最少的是长寿的样本，特有OTUs数为190（图3）。图3OTU分布图

图3 OTU分布图

图2各样本的稀释曲线在97%一致性阈值下对7组样本的AlphaDiversity分析指数进行统计，结果如表1所示。本研究中，所有微生物群落多样性和丰富度的指标中来自江永的样本最高，来自长寿的样本最低。

图4 不同地区沙田柚果园土壤微生物群落结构的主坐标分析

在门分类水平对7组样本进行分析，样本细菌群落结构在门分类水平具有较高的多样性，对于不同样本来说，来自长寿的样本分离到的门数目最少，为33个；连山的最多，为49个。这些门主要包括变形菌门（Proteobacteria），不同样本的相对丰度在33.61%～40.87%之间；厚壁菌门（....

本文编号：4054496