对秀丽线虫中lincRNAs生理功能的系统研究

发布时间：2025-05-07 02:41

　　人类基因组中至少有78%的区域可以转录产生RNA,其中只有很少一部分RNA可以编码产生蛋白,其他的转录本都为非编码RNA。包括Piwi互作RNA(piRNA)、核小RNA(snRNA)、小 RNA(microRNAs)、长链非编码RNA(lncRNAs)等。之前一直认为这些非编码RNA是转录过程中的副产物,然而最近越来越多的研究表明,这些非编码RNA参与了生物体生命活动的各个方面。lncRNAs是一类序列长度超过200个碱基的非编码RNA,目前的研究表明lncRNAs以多种方式调控基因的转录,转录后修饰加工,翻译等过程。基因间的长链非编码RNA(lincRNAs)是lncRNAs的一种类型,它在基因组位置上不与其他基因重叠。目前已知的lincRNAs数量约占到lncRNAs的一半,在这些lincRNAs中只有不到1%的lincRNAs功能被揭示。而在这些有功能的lincRNAs中绝大多数的研究都是基于细胞水平上进行的,在个体水平上是否具有相同的功能还有待进一步的研究。并且在生物个体水平上,目前还没有针对lincRNAs进行系统功能研究的工作。为了解决上述问题,我们使用优化的CRISPR-...

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【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１长链非编码ＲＮＡ的分类（Ｒａｏ，?２０１７）??注：根据ＩｎｃＲＮＡｓ与编码蛋白的基因在基因组位置上的关系，将ＩｎｃＲＮＡｓ分为反义链??

ａｌ??ＩｎｃＲＮＡ），基因组位点上与编码基因有重叠的长链非编码ＲＮＡ（ｏｖｅｒｌａｐｐｉｎｇ?ｓｅｎｓｅ??ＩｎｃＲＮＡ），内含子来源的长链非编码ＲＮＡ?（ｉｎｔｒｏｎｉｃ?ＩｎｃＲＮＡ）和基因间的长链非??编码?ＲＮＡ（ｌｉｎｃＲＮＡ）。??Ｏｖｅｒｌａｐｐｉｎｇ?ｓｅｎｓｅ....

图３?ＣＲＩＳＰＲ－ｃａｓ９系统对基因的表达调控（Ｗａｎｇ?ｅｔ?ａｌ．，２０１６）??注：ＣＲＩＳＰＲｉ和ＣＲＩＳＰＲａ分别应用在基因的转录抑制（ａ）和转录激活（ｂ）中

ｓｙ?ｖｋｍ??ｄＣａｓ９?ＳＡＭ?ｓｙｓｔｅｍ??ｒｍｎｒＴＴＴｎｔｒｎｒ?ＮｍＴｎＴ！Ａｍｍ?ｎ？ｎｎｉＴｒｒ？ｎｒ?ＴｔｒｏｎｎｍｎＫＴｒ?ｒｆｉｒｒｒｉｎ＾ｗｉｒ?Ｎ？ｍｎ？ｒｆｔｍＴＴｍｒ??Ｉ：ｉｉ：ｉｉ：ｎ：ｉｉ；ｉｉ－ｍ?：ｎｍ：ｉｉ；ｎ：ｉａ?ｉ；？：ｉ？ｉｉｕ....

图５?ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ９系统示意图??注：对我们的ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ９系统进行适当的优化，提高ＣＲ丨ＳＰＲ－Ｃａｓ９的切割效率??

－ＮｙＮＴｖＴ＾ｖＮ．ＮＮＮＮＮＮＳＮ＾Ｎ＾ＫＮ＾ＮＮＸ?ＮＮ７ＣＮＮＮ?－５＊??ｉ?：?■?；?；?—?Ｍ?：?１?；?；?ｉ?；＊：?？：：??ｔｊｄＷＡ?５ｉ－ＮＮＮＮＮＮＫＮＮＫＫＮＴＣＮＴＷＮ＇ＮＯＧＯｌＵｌ；ＡＡｔｉＡＯＣＵＡＵＧＣＴＸ＾?＇??ＵＡ．＼．＼ｔＵＵ?....

图６?ｌｉｎｃＲＮＡ在不同染色体上的分布情况??接下来我们下载了?２６种线虫ｌｉｎｃＲＮＡｓ对应位点的注释信息来分析ｌｉｎｃＲＮＡｓ??在２６种线虫中序列的保守性（图７ｃ）

释的ｌｉｎｃＲＮＡｓ共有１７０个。为了系统的研究这些ｌｉｎｃＲＮＡｓ??的序列特征和表达特征，我们对秀丽线虫不同发育阶段和不同条件处理的九种状??态下的虫子进行了?ＲＮＡ深度测序（图９ａ，１０）。这九种分别为胚胎、ＬＩ、Ｌ２、??ｄａｕｅｒ、Ｌ３、Ｌ４、早期成虫、突变体（／？／ｗ....

本文编号：4043476