蜡梅响应乙烯的转录组分析及CpERF1基因的克隆

发布时间：2025-06-28 01:13

　　蜡梅作为常用的园林植物和木本切花,由于其独特的开花时间和浓郁的花香,具有较高的观赏价值和经济价值,其观赏价值主要取决于花朵的开放情况,为了探索乙烯是否影响蜡梅的花朵开放,本文使用乙烯和1-MCP处理蜡梅花朵,利用RNA-seq技术,探索乙烯对蜡梅花朵的影响及克隆乙烯响应因子基因,为调控蜡梅花朵开放,改善切花品质提供帮助。本研究的主要结果如下:1.在本研究中,提取蜡梅蕾期花朵总RNA,利用高通量Illumina HiSeq4000平台测序,共得到0h样本40264927条clean data、4h样本41064633条clean reads、4hEth样本39230880条clean reads、24h样本41158515条clean reads和24h1-mcp样本40851828条clean reads。用Trinity软件对所有的clean reads进行拼接,共得到了195349个转录本序列,平均长度为919bp。2.将拼接得到的Unigene序列与NR、SwissProt、COG、GO和KEGG等数据库进行比对,其中,共有52352（26.8%）条转录本序列在NCBI非冗余获得了...

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【部分图文】：

图1-1乙烯的生物合成途径[35]

西南大学硕士学位论文及叶片脱落、衰老等很多阶段都起着极其重要的调控作用[33-34]前体是蛋氨酸（Methionine），直接前体是1-氨基环丙烷-1-羧酸（公认的乙烯合成过程是通过YangCycle，蛋氨酸在蛋氨酸腺腺S-腺苷蛋氨酸，它是许多细胞的甲基供体，并在1-氨....

图1-2RNA-Seq的典型流程

西南大学硕士学位论文于传统的Sanger测序而言，基于高通量的RNA测序技术（RNA-Seq）经济且通量高，而且不需依附基因组信息即可进行转录组研究，大大加快了非模物的研究。RNA-Seq己经成为应用最为广泛的转录组研究方法。RNA-Se下诸多优势：（1）通量高；（2）....

图3-1真核转录组实验流程

图3-1真核转录组实验流程切及统计的原始图像数据经过BaseCalling转原始测序数据（RawData）文件。FQ碱基序列以及测序质量等基本信息。碱基质量字符，每个碱基质量字符对应系），即为该碱基的测序质量得分(Ph代表不同的碱基测序错误率，如当Q为1%和....

图3-2Trinity算法原理示意图

步Inchworm将原始序列建立起一个k-mergraph（K=25），通法寻找graph中的所有路径，inchworm每搜索到一条路径就“contig”，最后得到了一组“contig”；步Chrysalis，将第一步得到的“contig”进行分组，这时如果所得中....

本文编号：4054182