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猪脂肪合成过程分子调控网络的构建及相关基因转录水平的表达分析

发布时间:2025-05-11 05:05
  对猪脂肪沉积性状候选基因的研究多集中于基因多态性的研究,但由于脂肪沉积性状是数量性状,受控于多基因,各基因在不同时空状态下又受到多级上游基因的调控。因此,研究单个基因并不能全面解释脂肪沉积性状的遗传机理,挖掘影响脂肪沉积的基因,研究诸基因的表达关系成为研究脂肪沉积的关键。本研究基于文献挖掘的方法,以脂肪合成的生物化学过程为基础,确定脂肪酸合成、脂肪酸链的延长和去饱和、三酰甘油的合成三个阶段的催化反应酶及其编码基因,以及已见报道的对上述基因有调控作用的基因,以此构建脂肪合成的分子表达调控网络。 本文构建出了以PPARγ、LXRα、SREBP-1、ChREBP基因为主干的调控网络。网络中有多条通路可调控FASN、ACC、DGAT、GPAT、ACSL等脂肪合成催化酶的编码基因。包括PPARγ→LXRα→SREBP-1→FASN(ACC、Thrsp、S14R)通路,PPARγ→LXRα→ChREBP→FASN(ME、SCD1、Thrsp、ACC、FASN、S14R)通路及其他调控通路。FASN、ACC、DGAT、GPAT、ACSL等催化酶基因处于通路的最下游位置。 研究过程中发现,猪脂肪...

【文章页数】:58 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
Abstract
1 引言
    1.1 猪育种技术及其发展趋势
    1.2 猪脂肪细胞的分化增殖和肥大
    1.3 脂肪沉积性状
    1.4 脂肪合成相关基因
        1.4.1 ACC 基因
        1.4.2 THRSP 基因
        1.4.3 ACSL 基因
    1.5 本研究内容及意义
2 材料与方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验动物
        2.1.2 网络构建材料
        2.1.3 生物信息分析材料
        2.1.4 样本采集
        2.1.5 试验设备和仪器
        2.1.6 主要试剂
        2.1.7 需配制试剂
    2.2 试验方法和步骤
        2.2.1 猪脂肪合成基因网络的构建方法
        2.2.2 主要生物信息分析软件
        2.2.3 猪样品的采集
        2.2.4 总 RNA 的提取、纯化与反转录
        2.2.5 不同组织的表达量检测
        2.2.6 数据分析方法
3 结果与分析
    3.1 脂肪合成过程基因调控网络的构建
        3.1.1 甘油三酯生化合成催化酶的确定
        3.1.2 脂肪合成过程基因表达调控网络
    3.2 主要基因生物信息学分析
        3.2.1 脂肪合成过程基因染色体位置
        3.2.2 基因编码蛋白的一级结构分析
        3.2.3 基因编码蛋白的二级结构分析
        3.2.4 基因编码蛋白的功能预测
        3.2.5 蛋白亚细胞定位
        3.2.6 蛋白质结构域预测
    3.3 基因 mRNA 相对表达量分析结果
        3.3.1 总 RNA 的提取
        3.3.2 基因扩增曲线
        3.3.3 基因溶解曲线
        3.3.4 不同体重阶段 3 个基因的表达趋势及相关性分析
4 讨论
    4.1 脂肪合成的生化过程
    4.2 脂肪合成表达调控网络的构建
    4.3 关键基因转录蛋白的结构和性质
    4.4 关键基因的表达与调控
    4.5 有待进一步解决的问题
5 结论
参考文献
缩略词表
在读期间已发表论文
作者简历
致谢



本文编号:4044889

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