鸭甲肝病毒3型QZ1401株全基因组序列分析及部分毒力研究
发布时间:2025-05-15 06:46
鸭甲肝病毒(Duck hepatitis A virus,DHAV)及鸭星状病毒(Duck astrovirus)导致的鸭病毒性肝炎(Duck viral hepatitis,DVH),主要感染1~3周龄雏鸭,具有高度致死、传播迅速的特点。其中DHAV型鸭肝炎呈世界范围分布,给养鸭业带来极大的损失。为深入了解DHAV-3基因组变异情况,本研究对分离自山东青州的DHAV-3分离株QZ1401进行了全基因组序列测定及分析,对其部分毒力开展了研究。本研究主要内容包括以下两方面:1、DHAV-3山东青州分离株QZ1401的全基因组测序及结果分析本研究通过对DHAV-3青州分离株QZ1401进行分段RT-PCR扩增、测序及拼接,最终得到其全基因组序列,分析其全基因组结构,结果表明:QZ1401株的基因组结构为5’UTR-L-VP0-VP3-VP1-2A1-2A2-2B-2C-3A-3B-3C-3D-3’UTR;QZ1401株与其他GeneBank中登录的DHAV-3毒株存在很高的同源性,全基因组核苷酸同源性为92.7%99.4%,编码区的氨基酸序列的同源性为96.5%
【文章页数】:48 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 鸭甲肝病毒的概述
1.1.1 鸭甲肝病毒的分类地位
1.1.2 DHAV研究的发展史
1.2 DHAV的生物学特性
1.2.1 DHAV的结构特征及抵抗力
1.2.2 D H AV的致病性
1.2.3 D H AV的培养特性
1.3 DHAV-1 分子生物学研究进展
1.3.1 DHAV-3 基因组结构
1.3.2 DHAV-3 功能蛋白作用及其特性
1.4 DHAV的流行病学
1.5 DHAV的预防与治疗
1.5.1 DHAV的预防
1.5.2 治疗
1.6 本研究目的意义
2 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 菌 ( 毒 )
2.1.2 试验动物
2.1.3 酶和相关试剂
2.1.4 主要仪器
2.1.5 实验所用的溶液及其配制
2.1.6 全基因组扩增引物的设计与合成
2.2 方法
2.2.1 QZ1401株DHAV-3 的分离培养以及全基因组测序
2.2.2 QZ1401株DHAV-3 的毒力测定
3 结果与分析
3.1 QZ1401株DHAV-3 全基因组测序的结果分析
3.1.1 目的片段扩增结果
3.1.2 QZ1401株DHAV-3 全基因组结构测序结果拼接与同源
3.1.3 氨基酸进化树的构建与分析
3.1.4 VP1高变区氨基酸序列分析
3.2 毒力检测的结果
3.2.1 鸭胚半数致死量
3.2.2 雏鸭半数致死量
4 讨论
4.1 QZ1401株全基因组测序及分析
4.2 毒力测定
5 结论
参考文献
致谢
本文编号:4046409
【文章页数】:48 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 鸭甲肝病毒的概述
1.1.1 鸭甲肝病毒的分类地位
1.1.2 DHAV研究的发展史
1.2 DHAV的生物学特性
1.2.1 DHAV的结构特征及抵抗力
1.2.2 D H AV的致病性
1.2.3 D H AV的培养特性
1.3 DHAV-1 分子生物学研究进展
1.3.1 DHAV-3 基因组结构
1.3.2 DHAV-3 功能蛋白作用及其特性
1.4 DHAV的流行病学
1.5 DHAV的预防与治疗
1.5.1 DHAV的预防
1.5.2 治疗
1.6 本研究目的意义
2 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 菌 ( 毒 )
2.1.2 试验动物
2.1.3 酶和相关试剂
2.1.4 主要仪器
2.1.5 实验所用的溶液及其配制
2.1.6 全基因组扩增引物的设计与合成
2.2 方法
2.2.1 QZ1401株DHAV-3 的分离培养以及全基因组测序
2.2.2 QZ1401株DHAV-3 的毒力测定
3 结果与分析
3.1 QZ1401株DHAV-3 全基因组测序的结果分析
3.1.1 目的片段扩增结果
3.1.2 QZ1401株DHAV-3 全基因组结构测序结果拼接与同源
3.1.3 氨基酸进化树的构建与分析
3.1.4 VP1高变区氨基酸序列分析
3.2 毒力检测的结果
3.2.1 鸭胚半数致死量
3.2.2 雏鸭半数致死量
4 讨论
4.1 QZ1401株全基因组测序及分析
4.2 毒力测定
5 结论
参考文献
致谢
本文编号:4046409
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/4046409.html
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