基于小RNA测序和数据库比对探究PRMT1调控的sncRNAs在哮喘中的作用

发布时间：2025-06-04 03:55

　　 小非编码RNA(small non-coding RNA,sncRNA)包括microRNA(miRNA)和PIWI蛋白互作RNA(PIWI-interacting RNA,piRNAs),其异常表达参与支气管哮喘(简称哮喘)气道上皮炎症过程。目前的研究多基于哮喘相关sncRNA的异常表达功能研究,少有对sncRNA表达变化原因的探究。我们前期的研究发现,蛋白质精氨酸甲基转移酶1(protein arginine methyltransferase 1,PRMT1)作为哮喘标志性分子,参与上皮细胞炎症的发生和气道下重塑。本文利用过表达人肺上皮细胞BEAS-2B中哮喘标志性基因PRMT1,进行sncRNA深度测序并与哮喘数据库联合分析,将差异表达的sncRNA与5个Gene Expression Omnibus(GEO)测序数据集进行比较,发现23种PRMT1调控的哮喘相关的sncRNA。利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证,筛选出12种miRNA和2种piRNA。将这些sncRNA靶基因与哮喘病人生成的上皮细胞样本mRNA测...

【文章页数】：12 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 细胞培养与转染
    1.2 小RNA-Seq测序文库的构建
    1.3 小RNA测序结果及分析
    1.4 NCBI数据分析与比较
    1.5 实时荧光定量PCR
    1.6 哮喘病人肺上皮细胞中的差异表达基因(DEG)
    1.7 miRNA和piRNA靶基因预测
    1.8 KEGG功能分析
    1.9 蛋白质免疫印迹分析
    1.10 统计学方法
2 结果
    2.1 人肺上皮细胞系BEAS-2B过表达PRMT1
    2.2 BEAS-2B细胞sncRNA分析
    2.3 哮喘中sncRNA网络的识别
    2.4 建立新的哮喘相关PRMT1-sncRNA调控网络
    2.5 预测差异表达的miRNA和piRNA揭示53种主要的靶基因失调影响RTK-Ras/Rap1- MAPK信号通路
3 讨论



本文编号：4049273