胃癌微转移、耐药预测标志及可重复的多维组学特征

发布时间：2025-07-02 04:02

　　造成胃癌治疗预后不良的两个主要的因素是转移(包括微转移)与耐药。本课题的研究目标是识别胃癌微转移、耐药的预测标志及可重复的多维组学特征。1.识别微转移与术后复发风险预测标志与胃癌转移相关的多维组学特征早期胃癌术后复发率很高,除了手术失败及几率较低的肿瘤重新发生的因素之外,临床影像及病理检测难以发现的微转移是术后复发的主要原因。因此,亟需发展预测胃癌微转移与术后复发风险的标志。另外,由于按TNM分期标识的转移与无转移临床样本存在较高的转移假阴性和假阳性率,在两类样本间难以识别独立可重复的差异表达基因。因此,我们做了如下两方面的研究。(1)识别微转移与术后复发风险预测标志:首先,利用77例仅接受手术治疗的早期胃癌患者的基因表达谱,识别了一个由COL8A1、PTPRE和NALCN等37个基因组成的19对基因标志(19 gene pair signature,19-GPS),根据每对基因在样本内的表达水平的相对高低秩序关系,通过多数投票规则预测早期胃癌微转移与术后复发风险。在两组分别包含71和46例样本的独立数据中,验证了该标志。(2)识别可重复的转移相关的多维组学特征:利用19-GPS排除可能...

【文章页数】：141 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图4.15-FU耐药预测标志的筛选的流程图

63图4.15-FU耐药预测标志的筛选的流程图9个基因中的任意两个基因，根据它们在胃癌组织样本内部的REO据集中的35个胃癌样本分成两组，然后估计两组间OS是否有显著差素Cox回归分析，控制p<0.05，我们识别了两对基因（KCNE2和PR和AP....

图4.2胃癌患者的OS和PFS生存曲线图

福建医科大学博士学位论文样本分别分为高、风险组，前者的OS显著短于后者（HR=2.78，95%CI：1.05-7.39，g-rankp=3.39E-02，见图4.2A）。在矫正了癌症分期、分级和性别这些临床因素，多因素Cox回归分析显示该标志仍然倾向有预后区分能力（p....

图5.15-FU耐药相关的有多维组学改变的特征基因的功能网络分析

图5.15-FU耐药相关的有多维组学改变的特征基因的功能网络分析：绿色的节点代表5-FU代谢相关基因；粉色的节点在A图中代表在耐药组中高甲基化且低达的基因，在B图中代表在耐药组中拷贝数扩增且高表达的基因，在C图中代表在敏感组频突变的基因；红色节点代表既有表观....

图5.2在耐药组相对于敏感组中高频扩增的7个拷贝数区域

图5.2在耐药组相对于敏感组中高频扩增的7个拷贝数区域我们分别统计了TCGA胃癌敏感、耐药组样本的突变基因个数的均值发现敏感组样本的平均突变基因数为366.69，显著高于在耐药样本中平均因数305.32（Wilcoxon秩和检验，p=3.75E-02）。提示基因....

本文编号：4055202