国际水稻种质资源抗稻瘟病全基因组关联分析

发布时间：2025-07-09 03:43

　　稻瘟病是水稻的三大病害之一,其严重影响了水稻的产量。目前主要通过图位克隆,分子标记等方法鉴定新的抗稻瘟病基因。本研究通过全基因组关联分析深度发掘自然群体中的抗稻瘟病新基因。为今后培育持久抗稻瘟病品种提供理论和实践意义。本研究利用5个稻瘟病生理小种对来自国际水稻所的584份多样性水稻种质资源进行接种鉴定,结合700K的高密度的SNP(单核苷酸多态性)图谱,利用全基因组关联分析发掘新的抗稻瘟病基因,筛选高抗品种。生理小种来自云南稻瘟病菌多样性中心其中包括YN485、YN661、YN716和来自浙江的稻瘟病生理小种RB22和来自韩国的稻瘟病生理小种RO1-1。所有的生理小种都是强致病性菌株。研究结果如下:1、对584份水稻国际种质资源进行接种鉴定,获得55份高抗稻瘟病品种,根据国际鉴定标准其对5个生理小种的抗性小于等于2级。2、温带粳稻亚群的平均感病率为77.08%,混合群体的平均感病率为52.82%,AUS亚群的平均感病率为49.5%,芳香亚群的平均感病率为47.8%,籼稻亚群的平均感病率为34.33%,热带粳稻亚群的平均感病率为27.38%。其中热带粳稻亚群的整体抗性远大于温带粳稻亚群的整...

【文章页数】：61 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1.群体中5个生理小种的抗性分布

10图1.群体中5个生理小种的抗性分布Figure1.Thedistributionof5isolatesforpopulationresistance由表1可知，来自云南稻瘟病生理小种YN485是从籼稻上分离而来的小种，其病性强，整体发病比较严重....

图2.群体亲缘关系图

3.3结果与分析3.3.1关联分析获得新的位点本研究中，利用高密度的SNP数据结合接种鉴定的结果。使用Tassel3.0结合700K的高密度单核苷酸多态性数据对其进行关联分析。亲缘关系图2可知在水稻多样性群体2中Indi（Indica）籼稻亚群占这个群体的....

图3.5个生理小种的曼哈顿散点图

18图3.5个生理小种的曼哈顿散点图Figure3．TheManhattanplotsof5isolates3.3.2候选基因分类根据基因注释的信息我们将获得候选基因进行分类。174个候选抗性基因分成9大类（图4）。其中编码转录因子、锌指酶等（Tra....

图4.候选基因的分类Figure4．Classificationofthecandidategenes

图4.候选基因的分类Figure4．Classificationofthecandidategenes3.4讨论本章中，我们利用获得的表型数据结合高密度的SNP数据进行全基因组关联分析，获得了与稻瘟病抗性相关的显著性标记。结合曼哈顿散点图筛选出P值较高的标记....

本文编号：4057096