亚洲棉GaPP2C24基因的克隆及表达分析

发布时间：2025-06-19 23:07

　　 PP2C是一大类重要的蛋白磷酸酶,广泛参与不同的逆境胁迫响应。为了解PP2C基因在干旱响应中的功能,以亚洲棉石系亚1号为材料,利用RT-PCR方法从中克隆了GaPP2C24基因,并对该基因进行了生物信息学分析,荧光定量PCR研究了其在亚洲棉不同组织和干旱胁迫下的表达情况。结果表明,GaPP2C24基因CDS序列全长为1 251 bp,编码416个氨基酸。序列同源比对发现,GaPP2C24与其他植物的PP2C氨基酸序列有较高的相似性,其中与可可树(EOY33930.1)、黄麻(OMO91132.1)的相似性分别为85%,84%。进化分析表明,GaPP2C24与同属锦葵目的黄麻聚在一支,亲缘关系最近,与可可树的亲缘关系次之。实时荧光定量PCR结果表明,GaPP2C24基因在子叶、下胚轴、胚根、叶、茎和根均有表达,且在茎中的表达量最高,根中次之。GaPP2C24受干旱胁迫的诱导表达,其在根和叶片中的相对表达量在处理1 h后最高,分别达到对照的53.9,6.9倍,推测该基因在棉花干旱响应中有重要作用。

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【部分图文】：

图1 GaPP2C24基因的克隆

根据本研究室石系亚1号干旱转录组测序获得的差异表达基因Cotton_A₁2895设计PCR特异引物,以石系亚1号叶片cDNA为模板进行PCR扩增,回收目的条带（图1）,克隆到pEASY-T3载体上,进行测序分析,测序结果与NCBI上公布的....

图2 GaPP2C24蛋白的二级结构

SOPM蛋白二级结构分析结果表明,编码该蛋白的139个氨基酸可能形成α螺旋(33.41%),107个氨基酸可能形成延伸带(25.72%),43个氨基酸可能形成β转角(10.34%),127个氨基酸可能形成无规则卷曲(30.53%)(图2)。利用SWISS-MODEL工具进行三维结....

图3 预测的GaPP2C24蛋白的三级结构

图2GaPP2C24蛋白的二级结构2.3GaPP2C24蛋白同源性和系统进化分析

图4 GaPP2C24与不同植物的PP2C氨基酸序列多重比对

将GaPP2C24氨基酸序列提交到NCBI进行BlastP比对,结果表明,GaPP2C24与可可树（EOY33930.1）、黄麻（OMO91132.1）的PP2C蛋白的相似性较高,分别为85%和84%,与拟南芥（NP₁72223.1）的相似性为56%。选取可....

本文编号：4051059