玉米GATA基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达分析

发布时间：2025-07-02 23:35

　　 利用生物信息学方法对玉米基因组中的GATA基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、染色体分布、系统进化、基因结构、保守基序进行分析,并分析其在热胁迫前后的表达水平变化,以期为玉米GATA基因功能研究奠定基础。结果表明,在玉米基因组中共鉴定到37个GATA基因,它们不均匀地分布在10条染色体上,均含有CX₂CX₁₈CX₂C保守基序;进化树分析表明,玉米GATA基因家族可分为A、B、C、D 4组,分别包含21、10、4、2个基因,同一组内的基因具有相似的基因结构。热胁迫处理后,玉米GATA家族成员中表达上调的基因有9个,包含A组5个（Zm00001d010785、Zm00001d023539、Zm00001d041883、Zm00001d025953、Zm00001d031135）,B组2个（Zm00001d011771、Zm00001d034751）,C组2个（Zm00001d036494、Zm00001d014656）;下调的基因有2个,均属于B组（Zm00001d016361和Zm00001d009193）。说明上调表达...

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【部分图文】：

图1 玉米GATA 基因的染色体分布

由图1可知,37个玉米GATA基因在10条染色体上不均匀分布,8号染色体上最多,含有6个基因;其次是1号、4号和5号染色体,均含有5个基因;6号和10号染色体分别含有4个基因;9号染色体上含有3个基因;2号和3号染色体分别含有2个基因;7号染色体上最少,只鉴定到1个基因。其中,4....

图2 玉米GATA基因的系统进化树

本研究将鉴定到的玉米GATA基因家族成员氨基酸序列与已知拟南芥GATA基因家族成员氨基酸序列进行比对,根据已知拟南芥GATA基因家族成员进化分类信息对玉米GATA基因家族进行分类(图2),玉米GATA基因家族可以分为4组(A、B、C、D),其中A组包含21个家族成员,占玉米GAT....

图3 玉米GATA基因家族成员基因结构

由图3可知,玉米GATA家族基因含有1～8个外显子,其中,A组含有1～3个外显子;B组的4个基因含有2个外显子,6个基因含有3个外显子;C组的4个基因(Zm00001d033523、Zm00001d013331、Zm00001d036494和Zm00001d014656)含有7～....

图4 玉米GATA基因家族保守基序

图3玉米GATA基因家族成员基因结构2.4玉米GATA基因家族成员应答热胁迫的表达分析

本文编号：4055416