鲤TRIM47生物特性初步探究及SVCV感染斑马鱼转录组学分析

发布时间：2025-05-07 04:13

　　SVC是由SVCV引起的一种重要的病毒性传染疾病,可引起多种鲤科鱼类严重的出血症状以及死亡现象,给养殖业造成了重大损失。TRIM家族蛋白具有多种生物学功能,其抗病毒活性引起较多关注。本研究拟从天然免疫角度探究TRIM47对SVCV的作用,以及采用RNA测序手段探究SVCV与其宿主的相互作用机制,为发现更多SVCV靶标奠定的理论基础。具体研究内容如下:一、鲤TRIM47生物特性分析及功能初步探究1)对TRIM47的序列特征进行比对和聚类分析,以及对鲤TRIM47的时空分布进行检测;2)体外SVCV感染可以显著抑制TRIM47 mRNA水平,但不影响TRIM47蛋白水平;3)TRIM47体外真核表达呈均匀点状分布在细胞质,亚细胞定位显示TRIM47部分定位在线粒体上;4)过表达TRIM47可以显著抑制SVCV-G mRNA的合成,在SVCV刺激下可显著上调IFN1 mRNA水平。二、SVCV感染斑马鱼转录组分析1)模拟自然感染的温度条件,将水温控制在17℃,斑马鱼腹腔注射SVCV,获得了良好的感染模型;2)SVCV感染斑马鱼转录组分析,在脑中检测到382个差异基因、脾中926个差异基因;3)...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1-1病毒及其基因组示意图（Ashrafetal.2016）

图1-1病毒及其基因组示意图（Ashrafetal.2016）（a）病毒粒子结构；（b）病毒基因组结构Fig.1-1SchematicofSVCVanditsgenome(Ashrafetal.2016)(a)Modelofviralstru....

图1-2TRIM/RBCC家族结构特征示意图（MeroniandDiez-Roux2005）

图1-2TRIM/RBCC家族结构特征示意图（MeroniandDiez-Roux2005）IM蛋白结构域模式图；（B）RING、B-box1和B-box2的化学结构式；（C）构域的种类Schematicofthedomainstructureof....

图4-1TRIM47基因PCR扩增（A）包含TRIM47CDS的序列扩增；（B）TRIM47扩增片段回收；（C）载体及TRIM47酶切后凝胶电泳回收

图4-1TRIM47基因PCR扩增（A）包含TRIM47CDS的序列扩增；（B）TRIM47扩增片段回收；（C）载体及TRIM47酶后凝胶电泳回收Fig.4-1ThePCRamplificationofTRIM47

图4-2TRIM47氨基酸序列比对斑马鱼、鲤、人类，鼠TRIM47氨基酸序列比对结果，其中高度保守的RING、B-box和PRY/SPRY（B30.2）结构域用粗线加以标注

图4-2TRIM47氨基酸序列比对斑马鱼、鲤、人类，鼠TRIM47氨基酸序列比对结果，其中高度保守的RING、B-box和PRY/SP（B30.2）结构域用粗线加以标注Fig.4-2AminoacidalimentsofTRIM47

本文编号：4043591