癫痫血浆蛋白质组学分析及相关基因功能鉴定

发布时间：2025-05-01 16:49

　　癫痫是临床上一种常见的慢性疾病,起病年龄跨阈大,以发作形式多样、反复发作为特点,对患者身体、精神、智力等均造成不同程度的影响,临床上可表现为多种癫痫综合征,也可演变为癫痫持续状态,甚至引起癫痫性猝死。癫痫的致病机制复杂,至今仍未阐明,由相关基因突变引起的细胞功能障碍可能为其致病原因之一。此外,近年来,组学技术在医学领域被越来越广泛地使用,作为其重要组成部分的蛋白质组学的迅速发展为临床上疾病标志物的识别、疾病的早期诊断、靶向干预提供了有力的技术支持。但是目前对癫痫的蛋白质组学研究多集中于动物模型或人脑组织标本,对于癫痫血浆蛋白质组学的研究仍不多见。本研究一方面应用定量蛋白质组学联合生物信息学技术对癫痫患者血浆差异蛋白进行筛选,一方面通过体外细胞实验对癫痫致病基因CACNA1A扩增突变引起细胞凋亡的机制进行研究。本文共分6章,主要内容在第3、4章,具体工作如下:⒈儿童Rolandic癫痫血浆TMT定量蛋白质组学分析（第3章）目的:应用TMT定量蛋白质组学技术对儿童Rolandic癫痫患者血浆中的差异表达蛋白进行分析,同时联合生物信息学技术对差异蛋白进行筛选、可视化,以寻求癫痫患者血浆中的可能...

【文章页数】：138 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图2.1 TMT定量蛋白质组原理及技术流程

TMT(TandemMassTags)技术是由美国Thermo公司研发的一种多肽体外标记定量技术。此类技术最多可采用10种稳定同位素标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,然后进行串联质谱分析,可同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量。TMT技术是常用的差异蛋白质组学技术、....

图3.1本章的总体流程图

本章的主要内容包括以下四个方面:⑴入组病人及对照组的临床信息采集;⑵各组血浆标本的收集;⑶蛋白的提取及鉴定;⑷差异表达蛋白的生物信息学分析。本章的总体流程图,如图3.1所示。3.2实验材料

图3.2.质谱数据的质控确认

图3.2中展示的是质谱数据的质控检测结果。首先,我们检测了所有鉴定到的肽段的质量偏移(masserror)(图3.2A)。质量误差以0为中轴并且集中在低于10ppm的范围内,说明质量误差符合要求。其次,绝大部分的肽段长度分布在8-20个氨基酸残基之间(图3.2B),符合胰酶消....

图3.2.质谱数据的质控确认

图3.2.质谱数据的质控确认3.3.11生物信息学分析

本文编号：4042609