胸腺上皮肿瘤预后相关DNA甲基化分子标志物的筛选和鉴定研究

发布时间：2025-06-06 01:04

　　背景胸腺上皮肿瘤（thymic epithelial tumors,TETs）是一种发源于胸腺上皮细胞的肿瘤,其发病率较低,大概为0.13/10万。根据2015年版世界卫生组织（World Health Organization,WHO）分型,胸腺上皮肿瘤被分为胸腺瘤（A、AB、B1、B2、B3型）和胸腺癌（C型）。目前胸腺上皮肿瘤的复发和生存预后判断主要依靠WHO分型和Masaoka分期。WHO分型中A、AB、B1、B2和B3型胸腺上皮肿瘤被认为恶性程度较低,较少复发,生存预后好,而C型胸腺上皮肿瘤被认为恶性程度高,易复发,生存预后差。Masaoka分期中,Ⅰ-Ⅱ期被认为复发风险低,生存预后好,而Ⅲ-Ⅳ期复发风险高,生存预后差。然而在实际临床运用中,依靠WHO分型和Masaoka分期来判断胸腺上皮肿瘤病人的复发和生存预后有一些局限性,例如恶性程度较低的A、AB、B1型胸腺瘤也会出现术后复发、早期转移等情况,影响患者的预后。因此寻找更加精准的生物标记物用于判定胸腺上皮肿瘤的预后具有重要的临床意义。DNA甲基化是基因表观遗传调控的重要方式,主要通过基因启动子区域的高甲基化沉默基因表达,从而...

【文章页数】：136 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图1.1癌症基因组图谱数据库

陆军军医大学博士学位论文域。美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所于2005年建立癌症基因组图谱数据库（TheCancerGenomeAtlas，TCGA)，它的网络数据下载地址是：http://cancergenome.nih.go....

图1.2基因表达综合数据库

陆军军医大学博士学位论文据库包含了4868个数据集，累计达到了2045092个样本，是世界上最大的也是最著名的芯片数据存贮和查询的全世界公益性数据库(图1.2所示)。GEO数据库建立的目的主要是：通过收录大量的高通量测序实验数据，为后期同行科学家数据挖掘和信息的推广....

图1.3UCSC数据库

图1.3UCSC数据库2.1.2实验方法2.1.2.1胸腺上皮肿瘤临床资料、DNA甲基化测序和转录组测序资料下载本研究访问TCGA数据库网站、UCSC数据库网站和GEO数据库网站下载胸腺上皮肿瘤病人临床资料、随访信息、全基因组DNA甲基化测序数据和全基因....

图1.4TCGA数据库中DNA甲基化测序资料

化DNA甲基化位点作为初始协变量，采用逐步逻辑回归分析法分析胸腺上皮肿瘤总生存期和无复发生存期的独立预测因子。根据以下标准，通过似然比试验选择变量：选择一个变量（p<0.05），而在反向删除步骤中排除p值大于0.1的变量[60]。采用ROC分析评价DNA甲基化预....

本文编号：4049554