早期宫颈腺癌临床特征与预后分析及其相关基因甲基化的研究
发布时间:2025-07-07 01:15
目的:1.通过回顾性分析新疆医科大学附属肿瘤医院收治的早期宫颈腺癌临床病理资料,探讨其与预后的关系,进一步确定宫颈腺癌的相关预后因素;2.筛选并初步探讨宫颈腺癌的甲基化差异位点和基因,明确其在宫颈腺癌组织中的表达和分布情况;3.分析目标SOX1、CCND1、PRKCA基因甲基化在早期宫颈腺癌组织中的表达差异性,寻找预测宫颈腺癌发生的分子标记物。方法:1.收集和整理2010年1月至2017年12月8年间新疆医科大学附属肿瘤医院收治进行了宫颈癌根治性手术的早期宫颈腺癌(ⅠB1-ⅡA2期)患者资料,对其中有可能影响宫颈腺癌预后的指标进行单因素和多因素的研究;2.采用Illumina850K甲基化芯片技术对5例宫颈腺癌组织及5例正常宫颈组织进行甲基化情况分析,筛选出DNA异常甲基化基因,通过基因本体(GO)功能注释、富集分析和KEGG信号转导通路富集分析,初步对宫颈腺癌甲基化情况进行分析;3.采用亚硫酸盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)及实时定量RT-PCR(Quantitative RealTime RT-PCR,Q-RT-PCR)方法对宫颈腺癌组织、宫颈鳞状...
【文章页数】:127 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
本文编号:4056260
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【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1-1早期宫颈腺癌5年无瘤生存率曲线
2.3宫颈腺癌复发及死亡危险因素分析本组患者中,复发17例,死亡12例,5年无瘤生存率81.20%,5年总生存率86.70%,早期宫颈腺癌5年无瘤生存曲线及5年总生存曲线见图1-1,图1-2。图1-1早期宫颈腺癌5年无瘤生存率曲线Figure1-1Fiveyearsu....
图2-1总DNA琼脂糖凝胶电泳图
样本存在部分降解,完整性有所缺失;倘若于其他位置存在杂带,表示包含有别的杂质(点样孔位置有条带可能为蛋白质或多糖,更远位置有条带可能为RNA)。见图2-1。图2-1总DNA琼脂糖凝胶电泳图Fig.2-1TotalDNAagarosegelelectrophores....
图2-2原始beta值的密度图
滤的探针比例,如果某个样本中滤掉的探针比例超过5%,就要考虑在后续的分析中去掉这个样本。默认我们使用BMIQ的方法进行beta值的标准化处理(Teschendorff,2013),详见图2-2,可见图中未见有异常的样本。标准化之后beta值的主成分分析(PCA分析),利用降维度的....
图2-3标准化之后beta值的PCA分析
新疆医科大学博士学位论文44图2-3标准化之后beta值的PCA分析Fig2-3PCAanalysisofbetavalueafterstandardization2.3甲基化相关分析2.3.1MVP(MethylationVariablePositi....
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